Дельтапротеобактерии - Deltaproteobacteria

Дельтапротеобактерии
Desulfovibrio vulgaris
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Протеобактерии
Учебный класс:	Дельтапротеобактерии
Заказы
Desulfarculales Desulfarculaceae Desulfobacterales Desulfobacteraceae Desulfobulbaceae Nitrospinaceae Десульфовибрионалес Desulfohalobiaceae Desulfomicrobiaceae Десульфонатроновые Десульфовибрионовые Desulfurellales Desulfurellaceae Desulfuromonadales Desulfuromonadaceae Geobacteraceae Myxococcales [Миксобактерии] Cystobacteraceae Myxococcaceae "Haliangiaceae " Kofleriaceae Nannocystaceae Phaselicystidaceae Polyangiaceae Syntrophobacterales Syntrophaceae Syntrophobacteraceae Syntrophorhabdaceae

В Дельтапротеобактерии являются классом Протеобактерии.^[1] Все разновидность этой группы, как и все Протеобактерии, Грамотрицательный.

В Дельтапротеобактерии составляют ветвь преимущественно аэробных родов, формирующих плодовое тело Миксобактерии какой выпуск миксоспоры в неблагоприятных условиях окружающей среды, и ветвь строго анаэробных родов, которая содержит большинство известных сульфат- (Десульфовибрио, Десульфобактер, Десульфококк, Десульфонемаи т. д.) и сероредуцирующие бактерии (например. Десульфуромонады spp.) наряду с несколькими другими анаэробными бактериями с другой физиологией (например, восстанавливающие трехвалентное железо Геобактер виды и синтрофический Пелобактер и Syntrophus виды).

Недавно была выявлена ​​патогенная внутриклеточная дельтапротеобактерия.^[2]

Было предложено, чтобы Дельтапротеобактерии быть разделенным на четыре новых типа: Desulfobacterota, Myxococcota, Бделловибрионотаи SAR324 (имя-заполнитель, ожидающее описания типа материала).^[3]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) ^[4] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)^[5]и филогения основана на высвобождении 111 LTP на основе 16S рРНК Проект "Все виды живого дерева" ^[6]

Тиобактерии

?Альгидимарина пропионика ♠ Кендалл и др. 2005 г.     ?Candidatus Entotheonella palauensis ' Haygood et al. 1999 г.     ?Candidatus Magnetoglobus multicellularis ' Abreu et al. 2007 г.     ?Deferrisoma camini Слободкина и др. 2012 г.     ?Десульфокалдус терранеус ♠ Thevenieau et al. 2004 г.     ?Desulfostipes sapovorans ♠ Myhr et al. 2000 г.     ?Nitrospina gracilis ♦ Уотсон и Уотербери, 1971 г.     ?Spirobacillus cienkowskii ♠ Мечников 1889       Десульфовибрионалес       Desulfurellaceae   Эпсилонпротеобактерии   Геоспириллий ♠     Тиомикроспира ♠     Nautiliaceae       Nitratiruptor tergarcus     Campylobacterales               Syntrophorhabdus aromaticivorans       Myxococcales (Плодоносящие планирующие бактерии)       Desulfuromonadales         Бактериоворакс [вкл. Peredibacter starrii ]     Desulfobulbaceae           Десульфомонил         Desulfobacterium anilini     Desulfarculus baarsii         Desulfobacca acetoxidans     Syntrophobacteraceae               Bdellovibrio bacteriovorus     Syntrophaceae       Desulfobacteraceae

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)
♣ Международный журнал систематической бактериологии или же Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии (IJSB / IJSEM) опубликованные виды, которые находятся в печати.

Рекомендации

1. "www.ncbi.nlm.nih.gov". Получено 2009-03-19.
2. Schmitz-Esser S, Haferkamp I, Knab S и др. (Сентябрь 2008 г.). «Lawsonia intracellularis содержит ген, кодирующий функциональную транслоказу АТФ / АДФ, подобную риккетсии, для использования хозяином». J. Bacteriol. 190 (17): 5746–52. Дои:10.1128 / JB.00391-08. ЧВК  2519521. PMID  18606736.
3. Уэйт Д.В., Чувочина М., Пеликан С., Паркс Д.Х., Йилмаз П., Вагнер М., Лой А., Наганума Т., Накаи Р., Уитман В.Б., Хан М.В., Куевер Дж., Хугенгольц П. (2020). "Предложение о реклассификации классов протеобактерий Дельтапротеобактерии и Олигофлексия, и тип Термодесульфобактерии на четыре типа, отражающих основные функциональные возможности ». Int J Syst Evol Microbiol. 70 (11): 5972–6016. Дои:10.1099 / ijsem.0.004213. PMID  33151140.
4. J.P. Euzéby. «Дельтапротеобактерии». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛПСН). Архивировано из оригинал на 2011-10-07. Получено 2013-03-20.
5. Сэйерс; и другие. «Дельтапротеобактерии». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2013-03-20.
6. Проект "Все виды живого дерева".«Выпуск 111 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2013-03-20.

внешняя ссылка

• Дельтапротеобактерии в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)