LIMK2 - LIMK2

LIMK2
Белок LIMK2 PDB 1x6a.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLIMK2, LIM-домен киназы 2
Внешние идентификаторыOMIM: 601988 MGI: 1197517 ГомолоГен: 55911 Генные карты: LIMK2
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение LIMK2
Геномное расположение LIMK2
Группа22q12.2Начинать31,212,239 бп[1]
Конец31,280,080 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LIMK2 217475 s в формате fs.png

PBB GE LIMK2 210582 s в формате fs.png

PBB GE LIMK2 202193 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_016733
NM_001031801
NM_005569

NM_001034030
NM_010718
NM_173053
NM_001361623

RefSeq (белок)

NP_001026971
NP_005560
NP_057952

NP_001029202
NP_034848
NP_774958
NP_001348552

Расположение (UCSC)Chr 22: 31.21 - 31.28 МбChr 11: 3.34 - 3.41 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

LIM-домен киназы 2 является фермент что у людей кодируется LIMK2 ген.[5][6][7]

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь LIM домены в них содержатся. LIM-домены представляют собой высококонсервативные богатые цистеином структуры, содержащие 2 цинковых пальца. Хотя цинковые пальцы обычно функционируют путем связывания с ДНК или РНК, мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия. LIM-киназа-1 и LIM-киназа-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией 2 N-концевых мотивов LIM и С-концевого домена протеинкиназы. Белок, кодируемый этим геном, фосфорилируется и активируется с помощью ROCK, нижестоящего эффектора Rho, а кодируемый белок, в свою очередь, фосфорилирует кофилин, ингибируя его активность деполимеризации актина. Считается, что этот путь способствует Rho-индуцированной реорганизации актинового цитоскелета. Для этого гена были обнаружены по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182541 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020451 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Окано И., Хираока Дж., Отера Х, Нуноуэ К., Охаши К., Ивашита С., Хираи М., Мидзуно К. (декабрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового семейства серин / треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM». Журнал биологической химии. 270 (52): 31321–30. Дои:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID  8537403.
  6. ^ Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
  7. ^ а б "Ген Entrez: LIMK2 LIM-домен киназы 2".

дальнейшее чтение

внешняя ссылка