PACSIN1 - PACSIN1

PACSIN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3HAH, 3HAI, 3Q84, 3QNI
Идентификаторы
Псевдонимы	PACSIN1, SDPI, протеинкиназа С и субстрат казеинкиназы в нейронах 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606512 MGI: 1345181 ГомолоГен: 22674 Генные карты: PACSIN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.31 Начните 34,466,061 бп[1] Конец 34,535,229 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 A3.3 Начните 27,655,509 бп[2] Конец 27,711,482 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с белками цитоскелета • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • связывание липидов • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • конец аксона • цитозоль • эндосома • проекция клетки • мембрана • миелин • клеточная мембрана • синапс • мембрана с оборками • соединение клеток • перинуклеарная область цитоплазмы • проекция нейрона • мембрана цитоплазматических везикул • цитоплазматический пузырек • Везикула, покрытая COPI • цитоскелет • фоторецепторный ленточный синапс • пресинаптическая эндоцитарная зона Биологический процесс • регуляция эндоцитоза • отрицательная регуляция эндоцитоза • локализация белка на мембране • морфогенез проекции нейронов • эндоцитоз • организация актиновых филаментов • развитие нейрона • положительная регуляция развития дендритов • тубуляция плазматической мембраны • эндоцитоз синаптических пузырьков • локализация белка на плазматической мембране • организация цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	29993	23969
Ансамбль	ENSG00000124507	ENSMUSG00000040276
UniProt	Q9BY11	Q61644
RefSeq (мРНК)	NM_001199583 NM_020804	NM_001286743 NM_001286744 NM_011861 NM_178365
RefSeq (белок)	NP_001186512 NP_065855	NP_001273672 NP_001273673 NP_035991 NP_848142
Расположение (UCSC)	Chr 6: 34,47 - 34,54 Мб	Chr 17: 27.66 - 27.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа С и субстрат казеинкиназы в нейронах белок 1 является фермент что у людей кодируется PACSIN1 ген.^[5][6]

Это нонсенс.

См. Научную литературу по Синдапин I в базе научной литературы PubMED.

Взаимодействия

PACSIN1 был показан взаимодействовать с GTPases семейства Dynamin (Dynamin 1, 2 и 3). На основании этого взаимодействия, его локализации и функциональной роли белок был назван синдапин I (синаптический динамин-ассоциированный белок I) - научное более полезное и более широко используемое название, чем PACSIN1.

• DNM1 > Qualmann et al., 1999

Впоследствии было опубликовано множество дополнительных взаимодействий (см. Базу данных PubMED и поиск синдапина I).

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для протеинкиназы C человека и субстрата казеинкиназы в протеине 1 нейронов (PACSIN1)

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124507 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040276 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Sumoy L, Pluvinet R, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (январь 2001 г.). «PACSIN 3 представляет собой новый цитоплазматический адаптерный белок SH3-домена из семейства генов паксин-синдапин-FAP52». Ген. 262 (1–2): 199–205. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00531-X. PMID  11179684.
6. «Ген Entrez: протеинкиназа С PACSIN1 и субстрат казеинкиназы в нейронах 1».

дальнейшее чтение

• Квалманн Б., Роос Дж., ДиГрегорио П.Дж., Келли Р.Б. (февраль 1999 г.). «Синдапин I, синаптический динамин-связывающий белок, который связывается с нейронным белком синдрома Вискотта-Олдрича». Молекулярная биология клетки. 10 (2): 501–13. Дои:10.1091 / mbc.10.2.501. ЧВК  25183. PMID  9950691.
• Модреггер Дж., Риттер Б., Виттер Б., Полссон М., Пломанн М. (декабрь 2000 г.). «Все три изоформы PACSIN связываются с эндоцитарными белками и ингибируют эндоцитоз». Журнал клеточной науки. 113 (24): 4511–21. PMID  11082044.
• Zucconi A, Dente L, Santonico E, Castagnoli L, Cesareni G (апрель 2001 г.). «Выбор лигандов путем панорамирования библиотек доменов, отображаемых на фаге лямбда, выявляет новых потенциальных партнеров синаптоянина 1». Журнал молекулярной биологии. 307 (5): 1329–39. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4572. PMID  11292345.
• Васиак С., Куинн С.С., Риттер Б., де Хёвель Е., Баранес Д., Пломанн М., Макферсон П.С. (июль 2001 г.). «Ras / Rac-фактор обмена гуаниновых нуклеотидов у млекопитающих« Сын-семи »взаимодействует с PACSIN 1 / синдепином I, регулятором эндоцитоза и актиновым цитоскелетом». Журнал биологической химии. 276 (28): 26622–8. Дои:10.1074 / jbc.M100591200. PMID  11352907.
• Модреггер Дж., ДиПросперо Н.А., Чарльз V, Тагле Д.А., Пломанн М. (октябрь 2002 г.). «PACSIN 1 взаимодействует с хантингтином и отсутствует при варикозном расширении синапсов в мозге с пресимптомной болезнью Гентингтона». Молекулярная генетика человека. 11 (21): 2547–58. Дои:10.1093 / hmg / 11.21.2547. PMID  12354780.