PDE1B - PDE1B

PDE1B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ТАЗ, 4НПВ, 4NPW, 5B25
Идентификаторы
Псевдонимы	PDE1B, PDE1B1, PDES1B, HEL-S-79p, фосфодиэстераза 1B
Внешние идентификаторы	OMIM: 171891 MGI: 97523 ГомолоГен: 37370 Генные карты: PDE1B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.2 Начинать 54,549,601 бп[1] Конец 54,579,239 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 F3 Начинать 103,503,034 бп[2] Конец 103,530,052 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность 3 ', 5'-циклических нуклеотидов фосфодиэстеразы • связывание ионов металлов • связывание кальмодулина • активность циклических нуклеотидов фосфодиэстеразы • кальмодулин-зависимая активность циклической нуклеотидной фосфодиэстеразы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гидролазы сложного диэфира фосфорной кислоты • гидролазная активность • регулируемая кальцием и кальмодулином активность 3 ', 5'-циклической-GMP фосфодиэстеразы • Активность 3 ', 5'-циклического АМФ фосфодиэстеразы • Активность 3 ', 5'-циклической-GMP фосфодиэстеразы Сотовый компонент • цитоплазма • тело нейрональной клетки • цитозоль Биологический процесс • визуальное обучение • регуляция уровней нейротрансмиттеров • катаболический процесс цАМФ • двигательное поведение • ответ на амфетамин • метаболический процесс серотонина • дифференцировка моноцитов • регулирование метаболического процесса дофамина • клеточный ответ на стимул макрофагального колониестимулирующего фактора • катаболический процесс цГМФ • клеточный ответ на стимул гранулоцитарного макрофагального колониестимулирующего фактора • апоптотический процесс • преобразование сигнала • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5153	18574
Ансамбль	ENSG00000123360	ENSMUSG00000022489
UniProt	Q01064	Q01065
RefSeq (мРНК)	NM_000924 NM_001165975 NM_001288768 NM_001288769 NM_001315534 NM_001315535	NM_001285890 NM_008800 NM_001357980
RefSeq (белок)	NP_000915 NP_001159447 NP_001275697 NP_001275698 NP_001302463 NP_001302464	NP_001272819 NP_032826 NP_001344909
Расположение (UCSC)	Chr 12: 54,55 - 54,58 Мб	Chr 15: 103,5 - 103,53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальций / кальмодулин-зависимая 3 ', 5'-циклическая нуклеотидфосфодиэстераза 1B является фермент что у людей кодируется PDE1B ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123360 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022489 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цзян X, Ли Дж., Паскинд М., Эпштейн П.М. (ноябрь 1996 г.). «Ингибирование кальмодулин-зависимой фосфодиэстеразы вызывает апоптоз лейкозных клеток человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (20): 11236–41. Дои:10.1073 / пнас.93.20.11236. ЧВК  1074519. PMID  8855339.
6. Ю. Дж., Волда С. Л., Фрейзер А. Л., Флорио В. А., Мартинс Т. Дж., Снайдер П. Б., Харрис Е. А., Маккоу К. Н., Фаррелл К. А., Штайнер Б., Бентли Дж. К., Биво Д. А., Фергюсон К., Гелинас Р. (февраль 1998 г.). «Идентификация и характеристика человеческой кальмодулин-стимулированной фосфодиэстеразы PDE1B1». Сотовый сигнал. 9 (7): 519–29. Дои:10.1016 / S0898-6568 (97) 00046-6. PMID  9419816.
7. «Ген Entrez: PDE1B фосфодиэстераза 1B, кальмодулин-зависимая».

дальнейшее чтение

• Репаске Д. Р., Суиннен СП, Джин С. Л. и др. (1992). «Стратегия полимеразной цепной реакции для идентификации и клонирования кДНК циклической нуклеотидной фосфодиэстеразы. Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей кальмодулин-зависимую фосфодиэстеразу 63 кДа». J. Biol. Chem. 267 (26): 18683–8. PMID  1326532.
• Спенс С., Рена Дж., Салливан М. и др. (1997). «Рецептор-опосредованная стимуляция липидных сигнальных путей в клетках СНО вызывает быструю временную индукцию изоформы PDE1B Са2 + / кальмодулин-стимулированной фосфодиэстеразы цАМФ». Biochem. J. 321 (Pt 1) (Pt 1): 157–63. Дои:10.1042 / bj3210157. ЧВК  1218050. PMID  9003415.
• Заули Г., Милани Д., Мирандола П. и др. (2001). «Белок Tat ВИЧ-1 подавляет экспрессию фактора транскрипции CREB в нейрональных клетках PC12 посредством пути фосфатидилинозитол-3-киназы / AKT / циклической нуклеозидфосфодиэстеразы». FASEB J. 15 (2): 483–91. Дои:10.1096 / fj.00-0354com. PMID  11156964. S2CID  26315564.
• Фидок М., Миллер М., Ланфир Дж. (2002). «Выделение и дифференциальное распределение в тканях двух человеческих кДНК, кодирующих варианты сплайсинга PDE1». Клетка. Сигнал. 14 (1): 53–60. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00207-8. PMID  11747989.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Клетка. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бендер А.Т., Остенсон С.Л., Ван Э.Х., Биво Дж.А. (2005). «Селективная регуляция PDE1B2 при дифференцировке моноцитов в макрофаги». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (2): 497–502. Дои:10.1073 / pnas.0408535102. ЧВК  544304. PMID  15625104.
• Бендер А. Т., Биво Дж. А. (2006). «PDE1B2 регулирует цГМФ и подмножество фенотипических характеристик, приобретенных при дифференцировке макрофагов из моноцита». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (2): 460–5. Дои:10.1073 / pnas.0509972102. ЧВК  1326187. PMID  16407168.