RNF123 - RNF123

RNF123
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2MA6
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF123, KPC1, FP1477, белок безымянного пальца 123
Внешние идентификаторы	OMIM: 614472 MGI: 2148796 ГомолоГен: 11112 Генные карты: RNF123
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.31 Начните 49,689,538 бп[1] Конец 49,721,529 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F1 Начните 108,051,534 бп[2] Конец 108,083,346 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • не мембрана Биологический процесс • убиквитинирование белков • деубиквитинирование белков • протеолиз, участвующий в катаболическом процессе клеточного белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	63891	84585
Ансамбль	ENSG00000164068	ENSMUSG00000041528
UniProt	Q5XPI4	Q5XPI3
RefSeq (мРНК)	NM_022064	NM_032543 NM_001311152
RefSeq (белок)	NP_071347	NP_001298081 NP_115932
Расположение (UCSC)	Chr 3: 49.69 - 49.72 Мб	Chr 9: 108.05 - 108.08 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза RNF123 является фермент что у людей кодируется RNF123 ген.^[5]

Белок, кодируемый этим геном, содержит RING-палец, мотив, присутствующий во множестве функционально различных белков и, как известно, участвующий во взаимодействиях белок-белок и белок-ДНК.^[5]

Смотрите также

• RING finger домен

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164068 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041528 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: белок 123 безымянного пальца RNF123».

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). "Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфическая рекомбинация ". Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Ван Д., Гонг И, Цинь В. и др. (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Камура Т., Хара Т., Мацумото М. и др. (2005). «Цитоплазматическая убиквитинлигаза KPC регулирует протеолиз p27 (Kip1) в фазе G1». Nat. Cell Biol. 6 (12): 1229–35. Дои:10.1038 / ncb1194. PMID  15531880. S2CID  12225217.
• Котошиба С., Камура Т., Хара Т. и др. (2005). «Молекулярное рассечение взаимодействия между p27 и комплексом, способствующим убиквитилированию Kip1, убиквитинлигазой, которая регулирует протеолиз p27 в фазе G1». J. Biol. Chem. 280 (18): 17694–700. Дои:10.1074 / jbc.M500866200. PMID  15746103.
• Хара Т., Камура Т., Котошиба С. и др. (2005). «Роль белка KPC2 UBL-UBA в деградации p27 в фазе G1 клеточного цикла». Мол. Клетка. Биол. 25 (21): 9292–303. Дои:10.1128 / MCB.25.21.9292-9303.2005. ЧВК  1265808. PMID  16227581.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка

• RNF123 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)