SIAH2 - SIAH2

SIAH2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5Х9М
Идентификаторы
Псевдонимы	SIAH2, hSiah2, siah E3 убиквитин-протеинлигаза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602213 MGI: 108062 ГомолоГен: 21053 Генные карты: SIAH2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q25.1 Начинать 150,741,125 бп[1] Конец 150,763,477 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 D | 3 28,68 см Начинать 58,674,938 бп[2] Конец 58,692,400 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание конъюгированного с убиквитином фермента • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • нуклеоплазма • тело нейрональной клетки • ранняя эндосома • проекция нейрона • ядро клетки Биологический процесс • метаболический процесс клеточного белка • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • регуляция убиквитинирования белков • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • отрицательная регуляция апоптотического процесса • катаболический процесс клеточного белка • управление аксоном • развитие многоклеточного организма • убиквитинирование белков • клеточный цикл • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • апоптотический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты • полиубиквитинирование белков • деубиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути, активируемого нетрином • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • регулирование циркадного ритма • ритмический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6478	20439
Ансамбль	ENSG00000181788	ENSMUSG00000036432
UniProt	O43255	Q06986
RefSeq (мРНК)	NM_005067	NM_009174
RefSeq (белок)	NP_005058	NP_033200
Расположение (UCSC)	Chr 3: 150.74 - 150.76 Мб	Chr 3: 58.67 - 58.69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза SIAH2 является фермент что у людей кодируется SIAH2 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, входящий в состав семь заочных гомологов (SIAH) семья. Белок - это E3 лигаза и участвует в убиквитинирование и опосредованная протеасомами деградация определенных белков. Деятельность этого убиквитинлигаза участвует в регуляции клеточного ответа на гипоксия.^[6]

Взаимодействия

Было показано, что SIAH2 взаимодействовать с ПЭГ10,^[7] Синаптофизин,^[8] ПЭГ3^[9] и VAV1.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000181788 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036432 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж.Л., Сюй Т., Фирон ER (октябрь 1997 г.). «Семь гомологов млекопитающих заочно регулируют DCC посредством пути убиквитин-протеасома». Гены и развитие. 11 (20): 2701–14. Дои:10.1101 / gad.11.20.2701. ЧВК  316613. PMID  9334332.
6. "Entrez Gene: SIAH2 семь заочно гомологов 2 (Drosophila)".
7. Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура И. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека через взаимодействие с SIAH1». Исследования рака. 63 (12): 3043–8. PMID  12810624.
8. Уиллер Т.С., Чин Л.С., Ли Й, Роудабуш Флорида, Ли Л. (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина семерыми гомологами млекопитающих заочно». Журнал биологической химии. 277 (12): 10273–82. Дои:10.1074 / jbc.M107857200. PMID  11786535.
9. Relaix F, Wei XJ, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1 / Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и взаимодействует с Siah1a при p53-опосредованном апоптозе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (5): 2105–10. Дои:10.1073 / pnas.040378897. ЧВК  15761. PMID  10681424.
10. Germani A, Romero F, Houlard M, Camonis J, Gisselbrecht S, Fischer S, Varin-Blank N (май 1999 г.). «hSiah2 - это новый связывающий Vav белок, который ингибирует Vav-опосредованные сигнальные пути». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3798–807. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3798. ЧВК  84217. PMID  10207103.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ху Г., Чанг Ю.Л., Гловер Т., Валентин В., Look AT, Fearon ER (ноябрь 1997 г.). «Характеристика человеческих гомологов дрозофилы seven in absentia (sina)». Геномика. 46 (1): 103–11. Дои:10.1006 / geno.1997.4997. PMID  9403064.
• Ху Г., Фирон ER (январь 1999 г.). «N-концевой RING-домен Siah-1 необходим для функции протеолиза, а С-концевые последовательности регулируют олигомеризацию и связывание с белками-мишенями». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 724–32. Дои:10.1128 / mcb.19.1.724. ЧВК  83929. PMID  9858595.
• Germani A, Romero F, Houlard M, Camonis J, Gisselbrecht S, Fischer S, Varin-Blank N (май 1999 г.). «hSiah2 - это новый связывающий Vav белок, который ингибирует Vav-опосредованные сигнальные пути». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3798–807. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3798. ЧВК  84217. PMID  10207103.
• Relaix F, Wei XJ, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1 / Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и взаимодействует с Siah1a при p53-опосредованном апоптозе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (5): 2105–10. Дои:10.1073 / pnas.040378897. ЧВК  15761. PMID  10681424.
• Йоэнсуу Т., Хямяляйнен Р., Лехесйоки А.Е., де ла Шапель А., Санкила Е.М. (февраль 2000 г.). «Готовая карта последовательности критической области синдрома Ашера типа III на хромосоме 3q». Геномика. 63 (3): 409–16. Дои:10.1006 / geno.1999.6096. PMID  10704288.
• Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанного с ответами p53». Молекулярная клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
• Бём Дж., Хе Й., Грейнер А., Штаудт Л., Вирт Т. (август 2001 г.). «Регулирование стабильности BOB.1 / OBF.1 компанией SIAH». Журнал EMBO. 20 (15): 4153–62. Дои:10.1093 / emboj / 20.15.4153. ЧВК  149152. PMID  11483518.
• Уиллер Т.С., Чин Л.С., Ли Й, Роудабуш Флорида, Ли Л. (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина семерыми гомологами млекопитающих заочно». Журнал биологической химии. 277 (12): 10273–82. Дои:10.1074 / jbc.M107857200. PMID  11786535.
• Куценко А.С., Гизатуллин Р.З., Аль-Амин А.Н., Ван Ф., Кваша С.М., Подовский Р.М., Матушкин Ю.Г., Гянчандани А., Муравенко О.В., Левицкий В.Г., Колчанов Н.А., Протопопов А.И., Кашуба В.И., Киселев Л.Л., Вассерман В., Валлестед Забаровский Е.Р. (июль 2002 г.). «Фланкирующие последовательности NotI: инструмент для открытия генов и проверки генома человека». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (14): 3163–70. Дои:10.1093 / nar / gkf428. ЧВК  135748. PMID  12136098.
• Habelhah H, Frew IJ, Laine A, Janes PW, Relaix F, Sassoon D, Bowtell DD, Ronai Z (ноябрь 2002 г.). «Стресс-индуцированное снижение стабильности TRAF2 опосредовано Siah2». Журнал EMBO. 21 (21): 5756–65. Дои:10.1093 / emboj / cdf576. ЧВК  131073. PMID  12411493.
• Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура И. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека через взаимодействие с SIAH1». Исследования рака. 63 (12): 3043–8. PMID  12810624.
• Фанелли М., Фантоцци А., Де Лука П., Капродосси С., Мацузава С., Лазар М.А., Пеличчи П.Г., Минуччи С. (февраль 2004 г.). «Домен спиральной спирали является структурной детерминантой для гомологов млекопитающих Drosophila Sina-опосредованной деградации протеасомы промиелоцитарного лейкоза и других белков с трехчастным мотивом». Журнал биологической химии. 279 (7): 5374–9. Дои:10.1074 / jbc.M306407200. PMID  14645235.
• Germani A, Prabel A, Mourah S, Podgorniak MP, Di Carlo A, Ehrlich R, Gisselbrecht S, Varin-Blank N, Calvo F, Bruzzoni-Giovanelli H (декабрь 2003 г.). «SIAH-1 взаимодействует с CtIP и способствует его деградации протеасомным путем». Онкоген. 22 (55): 8845–51. Дои:10.1038 / sj.onc.1206994. PMID  14654780.
• Nakayama K, Frew IJ, Hagensen M, Skals M, Habelhah H, Bhoumik A, Kadoya T., Erdjument-Bromage H, Tempst P, Frappell PB, Bowtell DD, Ronai Z (июнь 2004 г.). «Siah2 регулирует стабильность пролилгидроксилаз, контролирует количество HIF1alpha и модулирует физиологические реакции на гипоксию». Клетка. 117 (7): 941–52. Дои:10.1016 / j.cell.2004.06.001. PMID  15210114. S2CID  1447980.