Streptomyces sp. мирофорея - Streptomyces sp. myrophorea
| Streptomyces sp. мирофорея | |
|---|---|
 | |
| Зрелые Streptomyces sp мирофорея, показывающая пыльные зеленые колонии с ложными концентрическими кольцами | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | Streptomyces разновидность |
| Разнообразие: | Streptomyces sp. изолят мирофореи McG1 |
Streptomyces sp. мирофорея, изолят McG1 это разновидность Streptomyces, который происходит от (этнофармакология ) народное лечение в городке Тонил-Норт в Бохо, графство Фермана.[1] Этот район ранее занимал Друиды (~ 1500 лет назад) и до этого неолит люди (~ 3700 лет назад), которые выгравировали Рейфад камни.[2] Streptomyces sp. мирофорея подавляет многие виды Патогены ESKAPE, могут расти при высоком pH (10,5) и могут переносить относительно высокие уровни радиоактивности.[1]
Физиология и морфология
Streptomyces sp. Изолят myrophorea McG1 имеет светло-зеленые или белые споры и гифы при культивировании на агаре SFM.[1]
Колонии Streptomyces sp. myrophorea имеют отчетливо пыльный вид и при созревании производят аромат, похожий на запах зародыша.[1] Эти бактерии производят множество спор шириной примерно 0,5-1,0 мкм, которые образуют прямые цепочки.[1]
Экология
Streptomyces sp. Изолят myrophorea McG1 был обнаружен в щелочной среде, богатой видами.
Эти бактерии растут при максимальном pH 10,5 и, следовательно, являются алкалифильными. Бактерии переносят повышенный уровень щелочности, но не развиваются.[1]
Streptomyces sp. myrophorea также может выдерживать относительно высокие уровни радиации (до 4 кГр. Это может быть связано с подстилающим известняком и сланцевым субстратом, который излучает радон.[1]
Производство антибиотиков
Только кластеры синтеза гена антибиотика были идентифицированы в Streptomyces sp. мирофорея; антибиотики, фактически производимые на месте, еще предстоит идентифицировать.[1] Streptomyces sp. McG1 широко ингибирует как грамположительные, так и грамотрицательные бактерии, включая карбапенем стойкий Acinetobacter baumannii, (критический патоген на Всемирная организация здоровья список приоритетных возбудителей), ванкомицин стойкий Enterococcus faecium, метициллин стойкий Золотистый стафилококк (указан как высокий приоритет) и Клебсиелла пневмонии.[1][3] Streptomyces sp. мирофорея имеет ограниченное действие против штаммов Enterococcus faecium и Синегнойная палочка.[1]
Щелочная толерантность
Streptomyces sp. myrophorea может процветать в щелочной среде, потому что она содержит много генов, аналогичных генам, связанным с толерантностью к щелочам у других видов бактерий.[4][5]
Streptomyces sp. myrophorea список генов щелочной толерантности:[1]
| Ген | Протеин |
|---|---|
| 504 | Щелочной шоковый белок 23 |
| 6561 | Щелочной шоковый белок 23 |
| 1049 | Аммоний / H + антипортерная субъединица amhM |
| 2800 | Аспартат / аланин-антипортер |
| 2801 | Аспартат / аланин-антипортер |
| 6218 | Аспартат / аланин-антипортер |
| 3284 | Повышенный внутриклеточный белок выживания |
| 159 | K + / H + антипортер nhaP |
| 3788 | K + / H + антипортер nhaP2 |
| 1050 | K + / H + антипортер yhaU |
| 2193 | K + / H + антипортер yhaU |
| 1325 | K + нечувствительный пирофосфатный протонный насос |
| 923 | Белок множественной лекарственной устойчивости mdtH |
| 3240 | Белок множественной лекарственной устойчивости mdtH |
| 3252 | Белок множественной лекарственной устойчивости mdtH |
| 6781 | Белок множественной лекарственной устойчивости mdtH |
| 1282 | Na + / H + антипортер nhaA |
| 4210 | Na + / H + антипортерная субъединица A |
| 4211 | Na + / H + антипортерная субъединица C |
| 4212 | Na + / H + антипортерная субъединица D |
| 4215 | Na + / H + антипортерная субъединица G |
| 660 | Na + / (H + или K +) антипортер gerN |
| 3425 | Na + / (H + или K +) антипортер gerN |
| 7210 | предполагаемый обменник Na + / H + |
| 1727 | Натрий, калий, литий и рубидий / H + антипортер |
Устойчивость к антибиотикам in vitro
Наличие генов устойчивости к антибиотикам часто связано с производством антибиотиков.[6] Stretpomyces sp. myrophorea устойчива к 28 антибиотикам и чувствительна к восьми антибиотикам в одной серии тестов. Антибиотики были протестированы при концентрациях, рекомендованных Европейским комитетом по тестированию чувствительности к противомикробным препаратам - EUCAST, для проверки чувствительности к противомикробным препаратам.[1][7]
Чувствительность к антибиотикам из Streptomyces sp. мирофорея:[1]Чувствительность записывается как: чувствительность (S), резистентность (R) или средняя (I).
| Антибиотик | Количество (мкг) | Чувствительность |
|---|---|---|
| Амикацин | 30 | S |
| Ампициллин | 30 | р |
| Ампициллин + сульбактам | 20 | р |
| Аугментин | 30 | р |
| Апромицин | 20 | р |
| Карбенициллин | 20 | р |
| Цефепим | 30 | р |
| Цефтазидим | 10 | р |
| Ceftibuten | 30 | р |
| Цефокситин | 30 | р |
| Цефтриаксон | 30 | р |
| Цефуроксим | 30 | р |
| Цефурин | 5 | р |
| Ципрофлоксацин | 5 | р |
| Клавурановая кислота | 10 | р |
| Эртапенем | 10 | р |
| Эритромицин | 15 | я |
| Гентамицин | 10 | S |
| Имипенем | 10 | р |
| Канамицин | 20 | р |
| Линезолид | 10 | я |
| Меропенем | 10 | р |
| Мупирицин | 200 | р |
| Нетилмицин | 10 | S |
| Нитрофурантоин | 100 | р |
| Новобиоцин | 5 | р |
| Пиперациллин + тазобактам | 36 | р |
| Квинпристин + далропристин | 5 | р |
| Рифампицин | 5 | р |
| Стрептомицин | 20 | р |
| Тигециклин | 15 | р |
| Тетрациклин | 20 | р |
| Триметоприм + сульфаметоксазол | 25 | р |
| Ванкомицин | 5 | р |
Секвенирование всего генома
Последовательность генома Streptomyces sp. myrophorea, изолят McG1 депонирован в NCBI (TaxID 2099643), инвентарный номер биопробы SAMN08518548, инвентарный номер BioProject PRJNA433829, идентификатор представления: SUB3653175Префикс тега Locus: C4625. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/433829.[1]Ссылка на архив чтения последовательности NCBI (SRA) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?LinkName=biosample_sra&from_uid=8518548 Копии этой бактерии хранятся в Национальная коллекция типовых культур (NCTC), Великобритания[8] и Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) GmbH, Германия.[9]
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п Terra, L .; и другие. (2018). «Новый алкалифильный Streptomyces ингибирует патогены ESKAPE». Границы микробиологии. 9: 2458. Дои:10.3389 / fmicb.2018.02458. ЧВК 6232825. PMID 30459722.
- ^ Эндрю Халпин; Конор Ньюман (2006). Ирландия: оксфордский археологический путеводитель по местам с древнейших времен до 1600 г.. Издательство Оксфордского университета. п.8. ISBN 978-0-19-280671-0.
- ^ «Глобальный приоритетный список устойчивых к антибиотикам бактерий для руководства исследованиями, открытием и разработкой новых антибиотиков». Всемирная организация здоровья.
- ^ Holdsworth, S. R .; Закон, К. Дж. (2013). «Белок множественной лекарственной устойчивости MdtM добавляет к репертуару антипортеров, участвующих в гомеостазе щелочного pH у Escherichia coli». BMC Microbiology. 13: 113. Дои:10.1186/1471-2180-13-113. ЧВК 3668916. PMID 23701827.
- ^ Krulwich, T. A .; Sachs, G .; Падан, Э. (2011). «Молекулярные аспекты измерения pH бактерий и гомеостаза». Обзоры природы Микробиология. 9 (5): 330–343. Дои:10.1038 / nrmicro2549. ЧВК 3247762. PMID 21464825.
- ^ Нодуэлл, Дж. Р. (2007). «Новые связи между устойчивостью к антибиотикам и производством антибиотиков». Журнал бактериологии. 189 (10): 3683–3685. Дои:10.1128 / JB.00356-07. ЧВК 1913332. PMID 17384190.
- ^ "Европейский комитет по тестированию чувствительности к противомикробным препаратам - EUCAST". Получено 2018-10-13.
- ^ «Национальная коллекция типовых культур (NCTC)». Общественное здравоохранение Англии. Получено 2018-10-13.
- ^ "Институт Лейбница DSMZ-Немецкая коллекция микроорганизмов и культур клеток". Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH. Получено 2018-10-13.
внешняя ссылка
- Терра, Лучиана; Дайсон, Пол Дж .; Хитчингс, Мэтью Д.; Томас, Лиам; Абдельхамид, Аля; Banat, Ibrahim M .; Gazze, Salvatore A .; Вуяклия, Душица; Facey, Пол Д .; Фрэнсис, Льюис В .; Куинн, Джерри А. (2018). «Новый алкалифильный Streptomyces ингибирует патогены ESKAPE». Границы микробиологии. 9: 2458. Дои:10.3389 / fmicb.2018.02458. ЧВК 6232825. PMID 30459722.
- "Streptomyces McG # 1 из Бохо в Северной Ирландии".
- Терра, Лучиана; Дайсон, Пол Дж .; Хитчингс, Мэтью Д.; Томас, Лиам; Абдельхамид, Аля; Banat, Ibrahim M .; Gazze, Salvatore A .; Вуяклия, Душица; Facey, Пол Д .; Фрэнсис, Льюис В .; Куинн, Джерри А. (2018). «Новый алкалифильный Streptomyces ингибирует патогены ESKAPE». Границы микробиологии. 9: 2458. Дои:10.3389 / fmicb.2018.02458. ЧВК 6232825. PMID 30459722.