ARNT2 - ARNT2

ARNT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT2, WEDAS, bHLHe1, ядерный транслокатор 2 рецептора арильных углеводородов
Внешние идентификаторы	OMIM: 606036 MGI: 107188 ГомолоГен: 7230 Генные карты: ARNT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q25.1 Начинать 80,404,350 бп[1] Конец 80,597,933 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 D3 | 7 48,35 см Начинать 84,246,278 бп[2] Конец 84,410,176 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание арилуглеводородного рецептора • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • ответ на эстрадиол • ответ на гипоксию • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция апоптотического процесса • внутриутробное эмбриональное развитие • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие центральной нервной системы • развитие мозга • положительное регулирование пролиферации клеток • ксенобиотический метаболический процесс • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9915	11864
Ансамбль	ENSG00000172379	ENSMUSG00000015709
UniProt	Q9HBZ2	Q61324
RefSeq (мРНК)	NM_014862	NM_007488
RefSeq (белок)	NP_055677 NP_055677.3	NP_031514
Расположение (UCSC)	Chr 15: 80,4 - 80,6 Мб	Chr 7: 84,25 - 84,41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный транслокатор 2 арилуглеводородного рецептора это белок что у людей кодируется ARNT2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член суперсемейства факторов транскрипции basic-helix-loop-helix-Per-Arnt-Sim (bHLH-PAS). Кодируемый белок действует как партнер для нескольких сенсорных белков семейства bHLH-PAS, образуя гетеродимеры с сенсорными белками, которые связывают регуляторные последовательности ДНК в генах, реагирующих на стимулы развития и окружающей среды. В условиях гипоксии кодируемые белковые комплексы с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа в ядре, и этот комплекс связывается с реагирующими на гипоксию элементами в энхансерах и промоторах чувствительных к кислороду генов. Очень похожий белок у мышей образует функциональные комплексы как с арилуглеводородными рецепторами, так и с однонаправленными белками, что предполагает дополнительные роли кодируемого белка в метаболизме ксенобиотических соединений и регуляции нейрогенеза соответственно.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172379 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015709 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wines ME, Lee L, Katari MS, Zhang L, DeRossi C, Shi Y, Perkins S, Feldman M, McCombie WR, Holdener BC (март 2001 г.). «Идентификация генов-кандидатов развития мезодермы (mesd) путем сравнительного картирования и анализа последовательности генома». Геномика. 72 (1): 88–98. Дои:10.1006 / geno.2000.6466. PMID  11247670.
6. «Ген Entrez: ядерный транслокатор 2 рецептора арил-углеводородов ARNT2».

внешняя ссылка

• Человек ARNT2 расположение генома и ARNT2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.
• Моффет П., Пеллетье Дж. (2000). «Различные транскрипционные свойства mSim-1 и mSim-2». FEBS Lett. 466 (1): 80–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01750-0. PMID  10648817.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Барроу Л.Л., Вайнс М.Э., Ромитти П.А. и др. (2003). «Ядерный транслокатор 2 рецептора арилуглеводородов (ARNT2): структура, картирование генов, полиморфизмы и оценка кандидатов для орофациальных щелей человека». Тератология. 66 (2): 85–90. Дои:10.1002 / tera.10062. PMID  12210012.
• Штольце I, Берхнер-Пфанншмидт У., Фрайтаг П. и др. (2002). «Гипоксия-индуцируемая экспрессия гена эритропоэтина в клетках нейробластомы человека». Кровь. 100 (7): 2623–8. Дои:10.1182 / кровь-2001-12-0169. PMID  12239177.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Оое Н., Сайто К., Миками Н. и др. (2004). «Идентификация нового основного фактора спираль-петля-спираль-PAS, NXF, показывает конкурентную, положительную регуляторную роль Sim2 в экспрессии гена дребрина, модулятора дендритного цитоскелета». Мол. Клетка. Биол. 24 (2): 608–16. Дои:10.1128 / MCB.24.2.608-616.2004. ЧВК  343817. PMID  14701734.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Фридман Э. Р., Фан СМ (2007). «Отдельные домены некдина связывают ARNT2 и HIF1alpha и подавляют транскрипцию». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 363 (1): 113–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.08.108. ЧВК  2083645. PMID  17826745.