ATRAID - ATRAID

ATRAID
Идентификаторы
Псевдонимы	ATRAID, APR - 3, APR-3, APR3, C2orf28, PRO240, p18, HSPC013, фактор дифференцировки, индуцированный полностью транс-ретиноевой кислотой
Внешние идентификаторы	MGI: 1918918 ГомолоГен: 15412 Генные карты: ATRAID
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п23.3 Начинать 27,212,027 бп[1] Конец 27,217,178 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 B1 Начинать 31,048,312 бп[2] Конец 31,054,623 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • неотъемлемый компонент мембраны • лизосомальная мембрана • клеточная мембрана • ядерная оболочка • мембрана • ядро клетки Биологический процесс • регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция пролиферации остеобластов • дифференциация клеток • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • положительное регулирование минерализации костей • отрицательная регуляция катаболического процесса клеточного белка Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51374	381629
Ансамбль	ENSG00000138085	ENSMUSG00000013622
UniProt	Q6UW56	Q6PGD0
RefSeq (мРНК)	NM_080592 NM_001170795 NM_016085	NM_027855 NM_212470
RefSeq (белок)	NP_001164266 NP_057169	NP_082131 NP_997635
Расположение (UCSC)	Chr 2: 27.21 - 27.22 Мб	Chr 5: 31.05 - 31.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с апоптозом белок 3 это белок что у людей кодируется ATRAID ген.^[5][6][7]

Считается, что этот ген участвует в апоптоз, а также может участвовать в кроветворный развитие и дифференциация. Два альтернативно соединенных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138085 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013622 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
6. Чжу Ф., Янь В., Чжао З.Л., Чай Ю.Б., Лу Ф., Ван Ц., Пэн В.Д., Янг А.Г., Ван СиДжей (ноябрь 2000 г.). «Улучшенная стратегия субтрактивной гибридизации на основе ПЦР для клонирования дифференциально экспрессируемых генов». Биотехнологии. 29 (2): 310–3. Дои:10.2144 / 00292st06. PMID  10948432.
7. «Ген Энтреса: открытая рамка считывания 28 хромосомы C2orf28».

внешняя ссылка

• Человек ATRAID расположение генома и ATRAID страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Ян Г, Ю Ф, Фу Х и др. (2007). «Идентификация различных промоторов для двух транскриптов белка 3, связанного с апоптозом, и их регуляция транскрипции с помощью NFAT и NFkappaB». Мол. Клетка. Биохим. 302 (1–2): 187–94. Дои:10.1007 / s11010-007-9440-7. PMID  17387583. S2CID  1525070.
• Ю Ф, Ян Г, Чжао З и др. (2007). «Связанный с апоптозом белок 3, мембранный белок с повышенной регуляцией ATRA останавливает клеточный цикл в фазе G1 / S, снижая экспрессию циклина D1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 358 (4): 1041–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.05.049. PMID  17524364.