GTF2A1L - GTF2A1L

GTF2A1L
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2A1L, ALF, субъединица 1 общего фактора транскрипции IIA, подобная
Внешние идентификаторы	OMIM: 605358 MGI: 1919078 ГомолоГен: 86732 Генные карты: GTF2A1L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п16.3 Начните 48,617,798 бп[1] Конец 48,733,148 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E4 Начните 88,668,660 бп[2] Конец 88,715,152 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • комплекс фактора транскрипции TFIIA • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • познание • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11036	71828
Ансамбль	ENSG00000242441	ENSMUSG00000024154
UniProt	Q9UNN4	Q8R4I4
RefSeq (мРНК)	NM_172196 NM_001193487 NM_006872	NM_023630
RefSeq (белок)	NP_001180416 NP_006863	NP_076119
Расположение (UCSC)	Chr 2: 48,62 - 48,73 Мб	Chr 17: 88,67 - 88,72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

TFIIA-альфа и бета-подобный фактор это белок что у людей кодируется GTF2A1L ген.^[5][6][7][8]

Сборка и стабильность РНК полимераза II транскрипционный преинициативный комплекс на эукариотический основной промотор вовлекает эффекты TFIIA о взаимодействии между ТАТА-связывающий белок (TBP) и ДНК.

Этот ген кодирует специфичный для зародышевых клеток аналог большой (альфа / бета) субъединицы общего фактора транскрипции TFIIA, который способен стабилизировать связывание ТВР с ДНК и может иметь уникальное значение для яичко биология. Был обнаружен альтернативный сплайсинг для этого локуса и два варианта, кодирующие различные изоформы, были идентифицированы.

Совместная транскрипция этого гена и соседнего вышестоящего гена генерирует редкий транскрипт (SALF), который кодирует гибридный белок состоящий из идентичности последовательности с каждым отдельным генным продуктом.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000242441 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024154 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Упадхьяя А.Б., Ли С.Х., ДеДжонг Дж. (Июль 1999 г.). «Идентификация общего гомолога фактора транскрипции TFIIAalpha / beta, избирательно экспрессируемого в семенниках». J Biol Chem. 274 (25): 18040–8. Дои:10.1074 / jbc.274.25.18040. PMID  10364255.
6. Xie W, Han S, Khan M, DeJong J (май 2002 г.). «Регуляция экспрессии гена ALF в тканях соматической и мужской зародышевой линии включает частичные и сайт-специфические паттерны метилирования». J Biol Chem. 277 (20): 17765–74. Дои:10.1074 / jbc.M200954200. PMID  11889132.
7. Хуанг М, Ван Х, Ли Дж, Чжоу З, Ду И, Лин М, Ша Дж (март 2006 г.). «Участие ALF в сперматогенезе человека и мужском бесплодии». Инт Дж Мол Мед. 17 (4): 599–604. Дои:10.3892 / ijmm.17.4.599. PMID  16525715.
8. «Ген Entrez: ALF TFIIA-альфа / бета-подобный фактор».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Loveys DA, Streiff MB, Kato GJ (1996). «Факторы транскрипции E2A основная спираль-петля-спираль негативно регулируются факторами роста сыворотки и белком Id3». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (14): 2813–20. Дои:10.1093 / nar / 24.14.2813. ЧВК  145994. PMID  8759016.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Малик С., Гермах М., Рёдер Р.Г. (1998). «Динамическая модель коактиваторной функции PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (5): 2192–7. Дои:10.1073 / пнас.95.5.2192. ЧВК  19292. PMID  9482861.
• Хан С.Ю., Чжоу Л., Упадхьяя А. и др. (2001). «TFIIAальфа / бета-подобный фактор кодируется геном, специфичным для зародышевых клеток, экспрессия которого повышается с помощью других общих факторов транскрипции во время сперматогенеза у мышей». Биол. Репрод. 64 (2): 507–17. Дои:10.1095 / биолрепрод64.2.507. PMID  11159353.
• Ёсида С., Охбо К., Такакура А. и др. (2002). «Sgn1, основной транскрипционный фактор спираль-петля-спираль, определяет клон клеток протока слюнной железы у мышей». Dev. Биол. 240 (2): 517–30. Дои:10.1006 / dbio.2001.0473. PMID  11784080.
• Упадхьяя А.Б., Хан М., Моу Т.С. и др. (2002). «Фактор транскрипции ALF, специфичный для зародышевых клеток. Структурные свойства и стабилизация комплекса ТАТА-связывающий белок (ТВР) -ДНК». J. Biol. Chem. 277 (37): 34208–16. Дои:10.1074 / jbc.M204808200. PMID  12107178.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Хоу М.Л., Мехмуд Ц.Ф., Саха С. и др. (2006). «Фактор транскрипции IIA tau связан с недифференцированными клетками, и его экспрессия гена подавляется в первичных нейронах на уровне хроматина in vivo». Стволовые клетки Dev. 15 (2): 175–90. Дои:10.1089 / scd.2006.15.175. PMID  16646664.
• Ким М., Ли Д., Цуй Й и др. (2006). «Взаимодействие регулирующих факторов и соматическое молчание специфичного для зародышевых клеток гена ALF». J. Biol. Chem. 281 (45): 34288–98. Дои:10.1074 / jbc.M607168200. PMID  16966320.