H2AFY - H2AFY

MACROH2A1
Белок H2AFY PDB 1u35.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMACROH2A1, H2A.y, H2A / y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, член семейства гистонов H2A Y, H2AFY, гистон macroH2A.1
Внешние идентификаторыOMIM: 610054 MGI: 1349392 ГомолоГен: 3598 Генные карты: MACROH2A1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение MACROH2A1
Геномное расположение MACROH2A1
Группа5q31.1Начинать135,333,900 бп[1]
Конец135,399,914 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE H2AFY 214500 в формате fs.png

PBB GE H2AFY 214501 s в формате fs.png

PBB GE H2AFY 207168 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001040158
NM_004893
NM_138609
NM_138610

NM_001159513
NM_001159514
NM_001159515
NM_012015

RefSeq (белок)

NP_001035248
NP_004884
NP_613075
NP_613258

NP_001152985
NP_001152986
NP_001152987
NP_036145

Расположение (UCSC)Chr 5: 135,33 - 135,4 МбChr 13: 56.07 - 56.14 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Корневой гистоновый макро-H2A.1 это белок что у людей кодируется H2AFY ген.[5][6][7]

Функция

Гистоны основные ядерные белки которые несут ответственность за нуклеосома структура хромосомного волокна в эукариоты. Нуклеосомы состоят примерно из 146 п.н. ДНК обернутый вокруг октамер гистонов состоит из пар каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). В хроматин волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона, H1, с ДНК между нуклеосомами, чтобы сформировать структуры хроматина более высокого порядка. Этот ген кодирует член семейства гистонов H2A. Он заменяет обычные гистоны H2A в подмножестве нуклеосом, где он репрессирует транскрипция и участвует в стабильной Инактивация Х-хромосомы. Альтернативная сварка приводит к множеству варианты расшифровки кодирование различных изоформ.[7] Экспрессия этих изоформ связана с несколькими видами рака, такими как гепатоцеллюлярная карцинома.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113648 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015937 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мао М, Фу Джи, Ву Дж.С., Чжан К.Х., Чжоу Дж., Кан LX, Хуан К.Х., Хе К.Л., Гу Б.В., Хан З.Г., Шен Й, Гу Дж, Юй Ю, Сюй Ш, Ван YX, Чен С.Дж., Чен З. (Июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 8175–80. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8175. ЧВК  20949. PMID  9653160.
  6. ^ Ли Ю., Хонг М., Ким Дж. У., Хон Ю. М., Чхве Ю.К., Чанг С.И., Ли К.С., Чхве И.С. (июль 1998 г.). «Выделение клонов кДНК, кодирующих подтипы человеческого гистона macroH2A1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1399 (1): 73–7. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00098-0. PMID  9714746.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: семейство гистонов H2AFY H2A, член Y».
  8. ^ Раппа Ф., Греко А., Подрини С., Каппелло Ф., Фоти М., Бургуан Л., Пейру М., Марино А., Скибетта Н., Уильямс Р., Маццоколи Г., Федеричи М., Пазиенца В., Винчигерра М. (2013). «Иммунопозитивность к изоформам гистона macroH2A1 указывает на ассоциированную со стеатозом гепатоцеллюлярную карциному». PLOS ONE. 8 (1): e54458. Дои:10.1371 / journal.pone.0054458. ЧВК  3553099. PMID  23372727.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого гистонового макро-H2A.1