HEXIM1 - HEXIM1

HEXIM1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2GD7, 3S9G
Идентификаторы
Псевдонимы	HEXIM1, CLP1, EDG1, HIS1, MAQ1, индуцибельный гексаметилен-бис-ацетамид 1, индуцибельный гексаметилен-бис-ацетамид 1, субъединица комплекса HEXIM P-TEFb 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607328 MGI: 2385923 ГомолоГен: 31382 Генные карты: HEXIM1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.31 Начните 45,148,502 бп[1] Конец 45,152,101 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E1 Начните 103,116,231 бп[2] Конец 103,119,725 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мяРНК • Связывание 7SK мяРНК • циклин-зависимая активность ингибитора серин / треонинкиназы Сотовый компонент • нуклеоплазма • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • положительная регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • развитие сердца • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • активация врожденного иммунного ответа • иммунная система • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10614	192231
Ансамбль	ENSG00000186834	ENSMUSG00000048878
UniProt	O94992	Q8R409
RefSeq (мРНК)	NM_006460	NM_138753
RefSeq (белок)	NP_006451	NP_620092
Расположение (UCSC)	Chr 17: 45.15 - 45.15 Мб	Chr 11: 103.12 - 103.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок HEXIM1 это белок что у людей кодируется HEXIM1 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

HEXIM1 был показан взаимодействовать с участием Циклин Т1^[6] и Cdk9^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186834 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048878 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хуанг Ф., Вагнер М., Сиддики М.А. (июль 2002 г.). «Структура, экспрессия и функциональная характеристика мышиного гена CLP-1». Ген. 292 (1–2): 245–59. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00596-6. PMID  12119119.
6. Михельс А.А., Нгуен В.Т., Фралди А., Лабас В., Эдвардс М., Боннет Ф, Ланиа Л., Бенсауд О. (июнь 2003 г.). «РНК MAQ1 и 7SK взаимодействуют с комплексами CDK9 / Cyclin T транскрипционно-зависимым образом». Mol Cell Biol. 23 (14): 4859–69. Дои:10.1128 / MCB.23.14.4859-4869.2003. ЧВК  162212. PMID  12832472.
7. «Энтрез Ген: гексаметилен-бис-ацетамид HEXIM1, индуцируемый 1».
8. Kobbi L, Demey-Thomas E, Braye F, Proux F, Kolesnikova O, Vinh J, Poterszman A, Bensaude O (октябрь 2016 г.). «Эволюционно консервативный пептид Hexim1 связывается с каталитическим сайтом Cdk9, чтобы ингибировать P-TEFb». Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (45): 12721–6. Дои:10.1073 / pnas.1612331113. ЧВК  5111705. PMID  27791144.

дальнейшее чтение

• Диас Нето Э, Корреа Р., Верджовски-Алмейда С., Брионес М. Р., Нагаи М. А., Да Силва В., Заго М. А., Бордин С., Коста Ф. Ф., Голдман Г. Х., Карвалью А. Ф., Мацукума А., Байя Г. С., Симпсон Д. Г., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Оучида Р., Кусухара М., Симидзу Н., Хисада Т., Макино Ю., Моримото К., Ханда Х., Осузу Ф., Танака Х. (2003). «Подавление экспрессии NF-kappaB-зависимого гена с помощью индуцируемого гексаметилен-бисацетамидом белка HEXIM1 в клетках гладких мышц сосудов человека». Гены Клетки. 8 (2): 95–107. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2003.00618.x. PMID  12581153. S2CID  21478049.
• Виттманн Б.М., Ван Н., Монтано М.М. (2003). «Идентификация нового ингибитора роста клеток груди, который подавляется эстрогенами и снижается в опухолях груди». Рак Res. 63 (16): 5151–8. PMID  12941847.
• Йик Дж. Х., Чен Р., Нисимура Р., Дженнингс Дж. Л., Линк А. Дж., Чжоу К. (2003). «Ингибирование транскрипции киназы P-TEFb (CDK9 / Cyclin T) и РНК-полимеразы II за счет скоординированных действий HEXIM1 и 7SK snRNA». Мол. Ячейка. 12 (4): 971–82. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00388-5. PMID  14580347.
• Паушкин С.В., Патель М, Фурия Б.С., Пельц С.В., Тротта CR (2004). «Идентификация комплекса эндонуклеаз человека выявляет связь между сплайсингом тРНК и образованием 3'-конца пре-мРНК». Ячейка. 117 (3): 311–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00342-3. PMID  15109492. S2CID  16049289.
• Yik JH, Chen R, Pezda AC, Samford CS, Zhou Q (2004). «Tat-подобный аргинин-богатый РНК-связывающий домен вируса иммунодефицита человека типа 1 необходим для HEXIM1 для ингибирования транскрипции РНК-полимеразы II посредством опосредованной 7SK snRNA инактивации P-TEFb». Мол. Cell. Биол. 24 (12): 5094–105. Дои:10.1128 / MCB.24.12.5094-5105.2004. ЧВК  419863. PMID  15169877.
• Михельс А.А., Фралди А., Ли К., Адамсон Т.Э., Боннет Ф., Нгуен В.Т., Седор С.К., Прайс Дж. П., Прайс Д.Х., Ланиа Л., Бенсауде О. (2005). «Связывание 7SK мяРНК превращает белок HEXIM1 в ингибитор P-TEFb (CDK9 / циклин Т)». EMBO J. 23 (13): 2608–19. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600275. ЧВК  449783. PMID  15201869.
• Yik JH, Chen R, Pezda AC, Zhou Q (2005). «Компенсирующий вклад HEXIM1 и HEXIM2 в поддержание баланса активных и неактивных положительных комплексов фактора элонгации транскрипции b для контроля транскрипции». J. Biol. Chem. 280 (16): 16368–76. Дои:10.1074 / jbc.M500912200. PMID  15713661.
• Byers SA, Price JP, Cooper JJ, Li Q, Price DH (2005). «HEXIM2, белок, родственный HEXIM1, регулирует положительный фактор элонгации транскрипции b посредством ассоциации с 7SK». J. Biol. Chem. 280 (16): 16360–7. Дои:10.1074 / jbc.M500424200. PMID  15713662.
• Шульте A, Czudnochowski N, Barboric M, Schönichen A, Blazek D, Peterlin BM, Geyer M (2005). «Идентификация Т-связывающего домена циклина в Hexim1 и биохимический анализ его конкуренции за связывание с ВИЧ-1 Tat». J. Biol. Chem. 280 (26): 24968–77. Дои:10.1074 / jbc.M501431200. PMID  15855166.
• Виттманн Б.М., Фуджинага К., Дэн Х., Огба Н., Монтано М.М. (2005). «Ингибитор роста клеток груди, ген 1 с пониженной регуляцией эстрогена, модулирует новое функциональное взаимодействие между рецептором эстрогена альфа и фактором удлинения транскрипции циклином Т1». Онкоген. 24 (36): 5576–88. Дои:10.1038 / sj.onc.1208728. PMID  15940264.
• Симидзу Н., Очида Р., Йошикава Н., Хисада Т., Ватанабэ Х., Окамото К., Кусухара М., Ханда Х, Моримото С., Танака Х (2005). «HEXIM1 образует транскрипционно абортивный комплекс с глюкокортикоидным рецептором без вовлечения 7SK РНК и положительного фактора элонгации транскрипции b». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (24): 8555–60. Дои:10.1073 / pnas.0409863102. ЧВК  1150813. PMID  15941832.
• Ли Кью, Price JP, Byers SA, Cheng D, Peng J, Price DH (2005). «Анализ большого неактивного комплекса P-TEFb показывает, что он содержит одну молекулу 7SK, димер HEXIM1 или HEXIM2 и две молекулы P-TEFb, содержащие Cdk9, фосфорилированный по треонину 186».. J. Biol. Chem. 280 (31): 28819–26. Дои:10.1074 / jbc.M502712200. PMID  15965233.
• Fraldi A, Varrone F, Napolitano G, Michels AA, Majello B, Bensaude O, Lania L (2006). «Ингибирование активности Tat белком HEXIM1». Ретровирология. 2: 42. Дои:10.1186/1742-4690-2-42. ЧВК  1183248. PMID  15992410.
• Дюлак С., Михельс А.А., Фралди А., Боннет Ф, Нгуен В.Т., Наполитано Г., Ланиа Л., Бенсауде О. (2005). «Зависимая от транскрипции ассоциация множественных единиц положительного фактора элонгации транскрипции с мультимером HEXIM». J. Biol. Chem. 280 (34): 30619–29. Дои:10.1074 / jbc.M502471200. PMID  15994294.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.