Институт Дж. Крейга Вентера - J. Craig Venter Institute

Институт Дж. Крейга Вентера в Роквилле, штат Мэриленд
Образовательный автобус возле института Дж. Крейга Вентера в Роквилле, штат Мэриленд

Координаты: 32 ° 52′09 ″ с.ш. 117 ° 14′35 ″ з.д. / 32,869107 ° с.ш.117,243037 ° з.д. / 32.869107; -117.243037

В Институт Дж. Крейга Вентера (JCVI) это некоммерческий геномика исследование институт, основанный Дж. Крейг Вентер, Кандидат наук. в октябре 2006 г. Институт стал результатом объединения четырех организаций: Центра развития геномики, Института геномных исследований (TIGR), Института биологических альтернатив энергии и Объединенного технологического центра научного фонда Дж. Крейга Вентера. Он имеет удобства в Роквилл, Мэриленд и Ла-Хойя, Калифорния.

Институт изучает общественный последствия геномики в дополнение к самой геномике. Исследования института связаны с геномной медициной; экологический геномный анализ; чистая энергия; синтетическая биология; этика, право и экономика. В институте работает более 200 человек, в том числе лауреат Нобелевской премии. Гамильтон Смит.

История

В 2004 году Центр развития геномики (TCAG), Институт биологических альтернатив энергии (IBEA) и Объединенный технологический центр института Дж. Крейга Вентера (JTC) были объединены и образовали Институт Дж. Крейга Вентера (JCVI). .[1]

в 1992 году Крейг Вентер работал исследователем в Национальные институты здоровья (НАЦИОНАЛЬНЫЕ ИНСТИТУТЫ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ США). В то же время он основал Институт геномных исследований (TIGR) и принимал участие в определении геном человека.[2][3][4] Из-за разногласий по поводу управления проектом TIGR был исключен из финансирования NIH в 1998 году.[5][6] Заметны политические, личные и этические конфликты гонки между государственным и частным секторами.[2][3][4][7][8][9][10][11][12]

В 1995 году предшественник Института Дж. Крейга Вентера, TIGR, определил последовательность: Mycoplasma genitalium и Methanococcus jannaschii.[13][14] В 1997 году TIGR определил геном Borrelia burgdorferi (который вызывает болезнь Лайма).[15] В 1998 году TIGR секвенировал геном Бледная трепонема (который вызывает сифилис).[16] В 1999 г. ТИГР опубликовал последовательность радиорезистентный полиэкстремофил Дейнококк радиодуранс.[17] TIGR секвенировал и проанализировал более 50 микробных геномов. ТИГР разработал искатель генов Мерцание и выравнивание последовательностей программа MUMmer. В Атаки сибирской язвы в 2001 году, ТИГР работал с Национальный фонд науки и ФБР, чтобы отследить штамм бацилла сибирской язвы используется в биотеррористических атаках.[18]

В июне 2000 года Вентер основал Центр развития геномики (TCAG), аналитический центр для изучения этики генетики человека и исследований стволовых клеток.[19][20]

Также в 2002 году Вентер основал Институт биологических альтернатив энергии (IBEA), чтобы исследовать использование микроорганизмов для производства альтернативных видов топлива (например, водорода) и секвестр диоксида углерода.[19] IBEA приступило к геномному секвенированию популяций микробов из окружающей среды, которые могут быть использованы.[21] Чтобы обеспечить поддержку этих объектов, Вентер создал Объединенный технологический центр института Дж. Крейга Вентера (JTC), который специализировался на высокопроизводительное секвенирование. Чтобы обеспечить административную и финансовую поддержку TIGR, TCAG, IBEA и JTC, Вентер создал некоммерческий фонд J. Craig Venter Science Foundation (JCVSF) для консолидации деятельности своих дочерних организаций.

В 2007 году институт опубликовал первый диплоидный геном человека, т.е. геном одного человека (Дж. Крейг Вентер), в котором были секвенированы оба набора хромосом.[22] В 2010 году институт определил 1,08 миллиона пар оснований. Mycoplasma mycoides геном, который затем был вставлен в клетку для создания первой клетки с полностью синтетическим геномом.[23]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ «Дж. Крейг Вентер объявляет об объединении трех исследовательских организаций в одну новую некоммерческую организацию - Институт Дж. Крейга Вентера» (Пресс-релиз). Институт Дж. Крейга Вентера. 29 сентября 2004 г.. Получено 20 марта 2012.
  2. ^ а б Шрив, Джеймс (2004). Война геномов: как Крейг Вентер пытался уловить код жизни и спасти мир. Кнопф. ISBN  0375406298.
  3. ^ а б Сулстон, Джон (2002). Общая тема: история науки, политики, этики и генома человека. Джозеф Генри Пресс. ISBN  0309084091.
  4. ^ а б "Гонка проекта" Геном человека ". Центр биомолекулярной науки и инженерии, Калифорнийский университет в Санта-Крус. Получено 20 марта 2012.
  5. ^ Прюитт, Ким Д. (1998). "WebWise: Путеводитель по веб-сайту Института геномных исследований". Геномные исследования. 8 (10): 1000–1004. Дои:10.1101 / гр. 8.10.1000. PMID  9799788. Получено 20 марта 2012.
  6. ^ Пенниси, Э. (1998). «ПРОЕКТ ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО ГЕНОМА: Планируемое усиление секвенирования генома, но план находится в разработке». Наука. 281 (5374): 148–149. Дои:10.1126 / science.281.5374.148. PMID  9687268.
  7. ^ Гузнер, Меррилл (19 декабря 2001 г.). «Патентование жизни». Американский проспект. Получено 20 марта 2012.
  8. ^ Макэлхени, Виктор К. (2010). Рисование карты жизни: внутри проекта генома человека. Основные книги. ISBN  978-0465043330.
  9. ^ Вентер, Дж. Крейг (2007). Расшифрованная жизнь: мой геном: моя жизнь. Викинг Взрослый. ISBN  978-0670063581.
  10. ^ Рабинов, Пол; Дан-Коэн, Талия (2004). Машина для создания будущего: биотехнологические хроники. Издательство Принстонского университета. ISBN  0691126143.
  11. ^ Шрив, Джеймс (август 2004 г.). «Эпическое путешествие Крейга Вентера, чтобы заново определить происхождение видов». Проводной. 12 (8). Получено 20 марта 2012.
  12. ^ Уэйд, Николас (27 июня 2000 г.). "Двойные ориентиры для Ватсона: спираль и геном". Нью-Йорк Таймс. Получено 20 марта 2012.
  13. ^ Фрейзер, К.; Gocayne, J.D .; Белый, O .; Adams, M.D .; Clayton, R.A .; Fleischmann, R.D .; Bult, C.J .; Kerlavage, A. R .; Sutton, G .; Kelley, J.M .; Fritchman, J. L .; Weidman, J. F .; Смолл, К. В .; Сандаски, М .; Fuhrmann, J .; Nguyen, D .; Utterback, T. R .; Саудек, Д. М .; Phillips, C.A .; Merrick, J.M .; Могила, J. ​​-F .; Dougherty, B.A .; Bott, K. F .; Hu, P. -C .; Люсьер, Т. С .; Peterson, S.N .; Smith, H.O .; Hutchison Ca, 3 .; Вентер, Дж. К. (1995). «Минимальный набор генов Mycoplasma genitalium». Наука. 270 (5235): 397–403. Bibcode:1995Научный ... 270..397F. Дои:10.1126 / science.270.5235.397. PMID  7569993.CS1 maint: числовые имена: список авторов (связь)
  14. ^ Bult, C.J .; Белый, O .; Olsen, G.J .; Zhou, L .; Fleischmann, R.D .; Sutton, G.G .; Blake, J. A .; Фитцджеральд, Л. М .; Clayton, R.A .; Gocayne, J.D .; Kerlavage, A. R .; Dougherty, B.A .; Могила, J. ​​-F .; Adams, M.D .; Reich, C.I .; Overbeek, R .; Киркнесс, Э. Ф .; Weinstock, K. G .; Merrick, J.M .; Глодек, А .; Scott, J. L .; Geoghagen, N. S. M .; Venter, J. F .; Fuhrmann, J. L .; Nguyen, D .; Utterback, T. R .; Kelley, J.M .; Peterson, J.D .; Sadow, P.W .; Ханна, М. С. (1996). «Полная последовательность генома метаногенного архея, Methanococcus jannaschii». Наука. 273 (5278): 1058–1073. Bibcode:1996Научный ... 273.1058B. Дои:10.1126 / science.273.5278.1058. PMID  8688087.
  15. ^ Фрейзер, К.; Casjens, S .; Huang, W. M .; Sutton, G.G .; Clayton, R .; Lathigra, R .; Белый, O .; Ketchum, K. A .; Dodson, R .; Hickey, E.K .; Gwinn, M .; Догерти, Б.; Tomb, J. F .; Fleischmann, R.D .; Richardson, D .; Peterson, J .; Kerlavage, A. R .; Quackenbush, J .; Зальцберг, С .; Hanson, M .; Van Vugt, R .; Palmer, N .; Adams, M.D .; Gocayne, J .; Weidman, J .; Utterback, T .; Watthey, L .; McDonald, L .; Artiach, P .; Боуман, К. (1997). "Геномная последовательность спирохеты болезни Лайма, Borrelia burgdorferi". Природа. 390 (6660): 580–586. Bibcode:1997Натура.390..580F. Дои:10.1038/37551. PMID  9403685.
  16. ^ Фрейзер, К.; Норрис, С. Дж .; Weinstock, G.M .; Белый, O .; Sutton, G.G .; Dodson, R .; Gwinn, M .; Hickey, E.K .; Clayton, R .; Ketchum, K. A .; Sodergren, E .; Hardham, J.M .; McLeod, M. P .; Зальцберг, С .; Peterson, J .; Халак, H .; Richardson, D .; Howell, J. K .; Chidambaram, M .; Utterback, T .; McDonald, L .; Artiach, P .; Bowman, C .; Cotton, M.D .; Fujii, C .; Гирлянда, С .; Люк, Б .; Хорст, К .; Робертс, К .; Сандаски, М. (1998). «Полная последовательность генома Treponema pallidum, спирохеты сифилиса». Наука. 281 (5375): 375–388. Bibcode:1998Sci ... 281..375F. Дои:10.1126 / science.281.5375.375. PMID  9665876.
  17. ^ Белый, O .; Eisen, J .; Heidelberg, J .; Hickey, E .; Peterson, J .; Dodson, R .; Haft, D .; Gwinn, M .; Nelson, W .; Richardson, D. L .; Moffat, K. S .; Цинь, H .; Jiang, L .; Pamphile, W .; Кросби, М .; Шен, М .; Vamathevan, J. J .; Напольная лампа.; McDonald, L .; Utterback, T .; Zalewski, C .; Макарова, К. С .; Aravind, L .; Daly, M. J .; Минтон, К. З .; Fleischmann, R.D .; Ketchum, K. A .; Нельсон, К. Э .; Зальцберг, С .; Смит, Х. О. (1999). «Последовательность генома радиорезистентной бактерии Deinococcus radiodurans R1». Наука. 286 (5444): 1571–1577. Дои:10.1126 / science.286.5444.1571. ЧВК  4147723. PMID  10567266.
  18. ^ Читать, Т. Д .; Зальцберг, С .; Поп, М .; Shumway, M .; Umayam, L .; Jiang, L .; Holtzapple, E .; Busch, J .; Smith, K .; Schupp, J.M .; Соломон, Д .; Keim, P .; Фрейзер, К. (2002). «Сравнительное секвенирование генома для открытия новых полиморфизмов у Bacillus anthracis». Наука. 296 (5575): 2028–2033. Bibcode:2002Наука ... 296.2028R. Дои:10.1126 / science.1071837. PMID  12004073.
  19. ^ а б "Следующий шаг геномного гиганта". Prisma Techniek. Получено 20 марта 2012.
  20. ^ "Сеть новостей генома". Получено 20 марта 2012.
  21. ^ Smith, H.O .; Фридман, Р. Вентер, Дж. Крейг (Лето 2003 г.). «Биологические решения для возобновляемых источников энергии». Мост. 33 (2). Получено 20 марта 2012.
  22. ^ Levy, S .; Sutton, G .; Ng, P.C .; Feuk, L .; Halpern, A. L .; Walenz, B.P .; Axelrod, N .; Huang, J .; Киркнесс, Э. Ф .; Денисов, Г .; Lin, Y .; MacDonald, J. R .; Pang, A. W. C .; Шаго, М .; Stockwell, T. B .; Tsiamouri, A .; Бафна, В .; Бансал, В .; Kravitz, S.A .; Busam, D.A .; Beeson, K. Y .; McIntosh, T. C .; Ремингтон, К. А .; Abril, J. F .; Gill, J .; Borman, J .; Rogers, Y.H .; Frazier, M.E .; Scherer, S.W .; Штраусберг, Р. Л. (2007). «Диплоидная последовательность генома отдельного человека». PLOS Биология. 5 (10): e254. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050254. ЧВК  1964779. PMID  17803354.
  23. ^ Гибсон, Д .; Glass, J .; Lartigue, C .; Носков, В .; Chuang, R .; Algire, M .; Бендерс, Г .; Montague, M .; Ma, L .; Муди, М. М .; Merryman, C .; Ваше, С .; Krishnakumar, R .; Assad-Garcia, N .; Andrews-Pfannkoch, C .; Денисова, Э. А .; Янг, L .; Qi, Z. -Q .; Segall-Shapiro, T. H .; Calvey, C.H .; Parmar, P. P .; Hutchison Ca, C.A .; Smith, H.O .; Вентер, Дж. К. (2010). «Создание бактериальной клетки под контролем химически синтезированного генома». Наука. 329 (5987): 52–56. Bibcode:2010Sci ... 329 ... 52G. Дои:10.1126 / science.1190719. PMID  20488990.

внешняя ссылка