Ligamenvirales - Ligamenvirales
| Ligamenvirales | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | incertae sedis |
| Королевство: | incertae sedis |
| Тип: | incertae sedis |
| Учебный класс: | incertae sedis |
| Заказ: | Ligamenvirales |
| Семьи | |
Ligamenvirales это отряд линейных вирусов, которые заражают археи королевства Crenarchaeota и имеют геномы двухцепочечной ДНК.[1] Заказ был предложен Давид Прангишвили и Март Крупович в 2012 году, впоследствии созданный Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV).
Название происходит от латинский лигамен, смысл нить или же нить.
Таксономия
В этом порядке есть две семьи - Lipothrixviridae и Rudiviridae.
Вироны нитевидные со спиральной нуклеокапсид. К каждому концу прикреплены волокна или более сложные структуры, участвующие в адгезии хозяина.
Основные белки оболочки как липотриксвирусов, так и рудивирусов имеют необычные четыреспираль пучковая топология.[2][3][4][5] В геном представляет собой несегментированную линейную двухцепочечную ДНК. Вирусы из двух семейств имеют до десяти общих генов. Основное различие между двумя семьями заключается в том, что члены семьи Rudiviridae не покрыты оболочкой, тогда как нуклеокапсиды липотриксвирусов окружены липидной мембраной. Кроме того, в то время как капсид рудивирусов состоит из одного главного капсидного белка, у липотриксвирусов капсидный белок состоит из двух паралогичных основных капсидных белков. В обеих группах вирусов основные белки капсида образуют димер, похожий на клешню (гомодимер в рудивирусах и гетеродимер в липотриксвирусах), который оборачивается вокруг дцДНК.
Члены Ligamenvirales структурно родственны архейным вирусам семейства Tristromaviridae которые, как и липотриксвирусы, кодируют два паралогичных главных белка капсида с такой же укладкой, как и в лигаменвирусах.[6] Из-за этих структурных сходств порядок Ligamenvirales и семья Tristromaviridae предлагалось объединить в класс Tokiviricetes (toki означает «нить» на грузинском языке и viricetes официальный суффикс класса вирусов).[6]
Рекомендации
- ^ Прангишвили Д; Крупович М (2012). "Новый предлагаемый таксон для двухцепочечных ДНК-вирусов, порядок Ligamenvirales". Arch Virol. 157 (4): 791–795. Дои:10.1007 / s00705-012-1229-7. PMID 22270758.
- ^ Гуле А., Бланги С., Реддер П., Прангишвили Д., Фелисберто-Родригес С., Фортерре П., Кампаначчи В., Камбиллау С. (2009) Белки оболочки нитчатого вируса 1 Acidianus демонстрируют спиральную складку, охватывающую ветвь вирусов нитчатых архей. PNAS 106 (50) 21155–60
- ^ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Крупович, М; Прангишвили, Д; Эгельман, EH (2015). «Вирусология. Вирус, поражающий гипертермофил, инкапсидирует ДНК А-формы». Наука. 348 (6237): 914–7. Дои:10.1126 / science.aaa4181. ЧВК 5512286. PMID 25999507.
- ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Крупович, М; Schouten, S; Прангишвили, Д; Эгельман, EH (2017). «Модель новой мембранной оболочки нитчатого гипертермофильного вируса». eLife. 6: e26268. Дои:10.7554 / eLife.26268. ЧВК 5517147. PMID 28639939.
- ^ Лю, Y; Осинский, Т; Ванга, Ф; Крупович, М; Schouten, S; Kasson, P; Прангишвили, Д; Эгельман, EH (2018). «Структурная консервация в оболочечном нитчатом вирусе, инфицирующем гипертермофильный ацидофил». Nature Communications. 9 (1): 3360. Bibcode:2018NatCo ... 9.3360L. Дои:10.1038 / s41467-018-05684-6. ЧВК 6105669. PMID 30135568.
- ^ а б Ван, Фэнбинь; Бакеро, Диана П.; Су, Чжанли; Осинский, Томаш; Прангишвили, Давид; Эгельман, Эдвард Х; Крупович, Март (2020). «Структура нитевидного вируса раскрывает семейные связи в виросфере архей». Эволюция вирусов. 6 (1): veaa023. Дои:10.1093 / ve / veaa023. ЧВК 7189273. PMID 32368353.