MRPS18A - MRPS18A

MRPS18A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J7Y, 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS18A, HumanS18b, MRP-S18-3, MRPS18-3, S18bmt, митохондриальный рибосомный белок S18A, S18mt-a, MRP-S18-a
Внешние идентификаторы	OMIM: 611981 MGI: 1915815 ГомолоГен: 32391 Генные карты: MRPS18A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p21.1 Начинать 43,671,303 бп[1] Конец 43,687,791 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 С Начинать 46,110,986 бп[2] Конец 46,128,910 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • связывание малых рибосомных субъединиц рРНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • внутриклеточный • митохондрия • митохондриальная малая рибосомная субъединица • цитозольная малая рибосомная субъединица • митохондриальная большая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • митохондриальный перевод Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55168	68565
Ансамбль	ENSG00000096080	ENSMUSG00000023967
UniProt	Q9NVS2	Q99N85
RefSeq (мРНК)	NM_001193343 NM_018135	NM_026768
RefSeq (белок)	NP_001180272 NP_060605	NP_081044
Расположение (UCSC)	Chr 6: 43,67 - 43,69 Мб	Chr 17: 46.11 - 46.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

28S рибосомный белок S18a, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPS18A ген.^[5][6][7]

Рибосомные белки митохондрий млекопитающих кодируются ядерными генами и помогают в синтезе белка в митохондриях. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. По оценкам, они содержат 75% белка и рРНК по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию по гомологии последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, который принадлежит к семейству рибосомных белков S18P. Кодируемый белок является одним из трех, которые имеют значительное сходство последовательностей с бактериальными белками S18. Первичные последовательности трех митохондриальных белков S18 человека не более тесно связаны друг с другом, чем с прокариотическими белками S18. Псевдоген, соответствующий этому гену, находится на хромосоме 3р.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000096080 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023967 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кавдар Коц Э, Буркхарт В., Блэкберн К., Мозли А., Спремулли Л.Л. (май 2001 г.). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомных белков». J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. Дои:10.1074 / jbc.M100727200. PMID  11279123.
6. Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т., Магури М., Куниба М., Хига С., Ватанабе К., Танака Т. (сентябрь 2001 г.). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
7. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPS18A S18A».

дальнейшее чтение

• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори С. и др. (2001). «Протеомный анализ митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация белковых компонентов в малой субъединице 28 S». J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. Дои:10.1074 / jbc.M103236200. PMID  11402041.