NAB2 - NAB2

NAB2
Идентификаторы
ПсевдонимыNAB2, MADER, NGFI-A-связывающий белок 2
Внешние идентификаторыOMIM: 602381 MGI: 107563 ГомолоГен: 4353 Генные карты: NAB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение NAB2
Геномное расположение NAB2
Группа12q13.3Начинать57,089,043 бп[1]
Конец57,095,476 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NAB2 216017 s в формате fs.png

PBB GE NAB2 212803 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005967
NM_001330305

NM_001122895
NM_008668

RefSeq (белок)

NP_001317234
NP_005958

NP_001116367
NP_032694

Расположение (UCSC)Chr 12: 57.09 - 57,1 МбChr 10: 127.66 - 127.67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

NGFI-A-связывающий белок 2 также известный как EGR-1-связывающий белок 2 или же белок замедленного раннего ответа, связанный с меланомой (MADER) - это белок что у людей кодируется NAB2 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков, связывающих NGFI-A (NAB), которые функционируют в ядре, подавляя или активируя транскрипция под влиянием некоторых членов EGR (реакция раннего роста) семья трансактиваторы. Белки NAB могут гомо- или гетеро-мультимеризоваться с другими белками EGR или NAB через консервативный N-концевой домен и репрессировать транскрипцию через два частично повторяющихся C-концевых домена. Репрессия транскрипции кодируемым белком частично опосредуется взаимодействиями с нуклеосома комплекс ремоделирования и деактилазы (NuRD). Альтернативно сращивание варианты транскриптов описаны, но их биологическая достоверность не определена.[7]

Патология

Рекуррентные соматические слияния двух генов, NGFI-A-связывающего белка 2 (NAB2) и STAT6, расположенные в хромосомной области 12q13, были идентифицированы в солитарные фиброзные опухоли.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166886 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025402 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сварен Дж., Севетсон Б.Р., Апель Э.Д., Зимонжич Д.Б., Попеску Н.С., Милбрандт Дж. (Август 1996 г.). «NAB2, корепрессор NGFI-A (Egr-1) и Krox20, индуцируется пролиферативными и дифференцированными стимулами». Mol Cell Biol. 16 (7): 3545–53. Дои:10.1128 / MCB.16.7.3545. ЧВК  231349. PMID  8668170.
  6. ^ Кирш К. Х., Корради Ю., Джонсон Дж. П. (июль 1996 г.). «Мадер: новый ядерный белок, сверхэкспрессируемый в меланомах человека». Онкоген. 12 (5): 963–71. PMID  8649813.
  7. ^ а б «Ген Entrez: NAB2 NGFI-A-связывающий белок 2 (EGR1-связывающий белок 2)».
  8. ^ Kabbinavar, F. F .; Hambleton, J; Mass, R.D .; Hurwitz, H.I .; Bergsland, E; Саркар, С (2005). «Комбинированный анализ эффективности: добавление бевацизумаба к фторурацилу / лейковорину улучшает выживаемость пациентов с метастатическим колоректальным раком». Журнал клинической онкологии. 23 (16): 3706–12. Дои:10.1200 / JCO.2005.00.232. PMID  15867200.

дальнейшее чтение