OCA2 - OCA2

OCA2
Идентификаторы
Псевдонимы	OCA2, BEY, BEY1, BEY2, BOCA, D15S12, EYCL, EYCL2, EYCL3, HCL3, PED, SHEP1, OCA2 меланосомный трансмембранный белок, P
Внешние идентификаторы	OMIM: 611409 MGI: 97454 ГомолоГен: 37281 Генные карты: OCA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q12-q13.1 Начните 27,754,875 бп[1] Конец 28,099,315 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B5 | 7 33,44 см Начните 56,239,760 бп[2] Конец 56,536,518 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • транспортная деятельность • Активность трансмембранного переносчика L-тирозина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • мембрана эндоплазматического ретикулума • лизосомальная мембрана • эндосомная мембрана • мембрана • цитоплазма • мембрана меланосомы • неотъемлемый компонент мембраны Биологический процесс • процесс биосинтеза глазного пигмента • пигментация • пигментация развития • процесс биосинтеза меланина • клеточная пролиферация • трансмембранный транспорт • развитие сперматид • дифференцировка меланоцитов • транспорт тирозина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4948	18431
Ансамбль	ENSG00000104044 ENSG00000277361	ENSMUSG00000030450
UniProt	Q04671	Q62052
RefSeq (мРНК)	NM_000275 NM_001300984	NM_021879
RefSeq (белок)	NP_000266 NP_001287913	NP_068679
Расположение (UCSC)	Chr 15: 27,75 - 28,1 Мб	Chr 7: 56,24 - 56,54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

P белок, также известен как белок-переносчик меланоцитов или розовые глаза гомолог белка разбавления, это белок что у людей кодируется глазокожный альбинизм II (OCA2) ген.^[5] Считается, что белок P интегральный мембранный белок участвует в транспорте малых молекул, в частности тирозин - предшественник меланин. Определенные мутации в OCA2 приводят к типу 2 глазокожный альбинизм.^[5] OCA2 кодирует человеческий гомолог мышиного гена p (розовое разведение).

У человека ген OCA2 расположен на длинном (q) плече хромосома 15 между положениями 12 и 13.1

Ген OCA2 человека расположен на длинном плече (q) хромосомы 15, в частности, от пары оснований 28 000 020 до пары оснований 28 344 457 на хромосоме 15.

Функция

OCA2 предоставляет инструкции по производству белка, называемого P-белком, который находится в меланоциты которые представляют собой специализированные клетки, производящие меланин, а в ячейках пигментный эпителий сетчатки. Меланин отвечает за цвет кожи, волос и глаз. Кроме того, меланин содержится в светочувствительной ткани сетчатки глаза, которая играет роль в нормальном зрении.

Точная функция белка P неизвестна, но было обнаружено, что он необходим для нормальной окраски кожа, глаза, и волосы; и вероятно участвует в меланин производство. Этот ген, по-видимому, является основным определяющим фактором цвета глаз в зависимости от количества продуцируемого меланином в организме человека. строма радужки (большие количества вызывают карие глаза; небольшое количество меланина вызывает голубые глаза).

Клиническое значение

Мутации в гене OCA2 вызывают нарушение нормального производства меланина; следовательно, вызывая проблемы со зрением и ухудшение цвета волос, кожи и глаз. Глазокожный альбинизм вызванный мутациями в гене OCA2, называется глазокожный альбинизм 2 типа. Распространенность ОСА типа 2 оценивается в 1/38 000–1 / 40 000 в большинстве групп населения во всем мире, с более высокой распространенностью среди африканского населения - 1/3 900–1 / 1,500.^[6] Другие заболевания, связанные с делецией гена OCA2: Синдром ангельмана (светлые волосы и светлая кожа) и Синдром Прадера-Вилли (необычно светлые волосы и светлая кожа). При обоих этих синдромах делеция часто встречается у людей с любым синдромом.^[7][8]

Мутация в HERC2 ген, прилегающий к OCA2, влияющий на экспрессию OCA2 в радужной оболочке человека, встречается почти у всех людей с голубые глаза. Была выдвинута гипотеза, что все голубоглазые люди имеют одного общего предка, от которого произошла мутация.^[9][10][11]

В His615Arg аллель OCA2 участвует в светлом оттенке кожи, и производный аллель ограничен Восточной Азией с высокими частотами, с самыми высокими частотами в Восточной Восточной Азии (49-63%), средними частотами в Юго-Восточной Азии и самыми низкими частотами в Западном Китае и некоторые восточноевропейские народы.^[12][13]

использованная литература

1. ENSG00000277361 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104044, ENSG00000277361 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030450 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: OCA2 окулокожный альбинизм II (гомолог разведения розовых глаз, мышь)». Получено 2015-03-12.
6. Хаяси, Масахиро; Сузуки, Тамио (апрель 2013 г.). «Глазокожный альбинизм 2 типа». Orphanet. Получено 2014-11-09.
7. «OCA2 - глазокожный альбинизм II». Домашний справочник по генетике - ваш путеводитель по генетическим заболеваниям. Национальная медицинская библиотека США. Получено 30 марта 2013.
8. "Разве это не делает твои карие глаза голубыми?". Понимание генетики. Понимание генетики. Получено 30 марта 2013.
9. Брайнер Дж. (31 января 2008 г.). "Вот что сделало эти карие глаза голубыми". Новости здоровья. Новости NBC. Получено 2008-11-06.; Брайнер Дж. (31 января 2008 г.). "Один общий предок за голубыми глазами". LiveScience. Imaginova Corp. Получено 2008-11-06.; «У голубоглазых людей есть общий предок». Новости. Копенгагенский университет. 2008-01-30. Получено 2008-11-06.
10. Eiberg H, Troelsen J, Nielsen M, Mikkelsen A, Mengel-From J, Kjaer KW, Hansen L (2008). «Синий цвет глаз у людей может быть вызван полностью связанной мутацией-основателем в регуляторном элементе, расположенном в гене HERC2, ингибирующем экспрессию OCA2». Гм. Genet. 123 (2): 177–87. Дои:10.1007 / s00439-007-0460-х. PMID  18172690. S2CID  9886658.
11. Штурм Р.А., Даффи Д.Л., Чжао З.З., Лейте Ф.П., Старк М.С., Хейворд Н.К., Мартин Н.Г., Монтгомери Г.В. (2008). «Один SNP в эволюционно консервативной области в интроне 86 гена HERC2 определяет сине-коричневый цвет глаз человека». Am. J. Hum. Genet. 82 (2): 424–31. Дои:10.1016 / j.ajhg.2007.11.005. ЧВК  2427173. PMID  18252222.
12. Доннелли М.П., ​​Пашоу П., Григоренко Е., Гурвиц Д., Барта С., Лу РБ, Жукова О.В., Ким Дж.Дж., Синискалько М., Нью-М, Ли Х., Каджуна С.Л., Манолопулос В.Г., Speed ​​WC, Пакстис А.Дж., Кидд-младший, Кидд К. (2012). «Общий взгляд на область OCA2-HERC2 и пигментацию». Гм. Genet. 131 (5): 683–96. Дои:10.1007 / s00439-011-1110-х. ЧВК  3325407. PMID  22065085.
13. Эдвардс М., Бигхэм А., Тан Дж., Ли С., Гоздзик А., Росс К., Джин Л., Парра Э. Дж. (2010). «Связь полиморфизма OCA2 His615Arg с содержанием меланина в популяциях Восточной Азии: еще одно свидетельство конвергентной эволюции пигментации кожи». PLOS Genet. 6 (3): e1000867. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000867. ЧВК  2832666. PMID  20221248.

дальнейшее чтение

• Оттинг WS, Кинг Р.А. (1999). «Молекулярные основы альбинизма: мутации и полиморфизмы генов пигментации, связанные с альбинизмом». Гм. Мутат. 13 (2): 99–115. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 13: 2 <99 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-C. PMID  10094567.
• Блестящий MH (2001). «Мышиные p (разведение с розовыми глазами) и человеческие P-гены, кожно-кожный альбинизм 2 типа (OCA2) и меланосомный pH». Пигментные клетки Res. 14 (2): 86–93. Дои:10.1034 / j.1600-0749.2001.140203.x. PMID  11310796.
• Рамзи М., Колман М.А., Стивенс Г., Цвейн Э, Кромберг Дж., Фаррол М., Дженкинс Т. (1992). «Положительный по тирозиназе локус окулокожного альбинизма отображается на хромосоме 15q11.2-q12». Am. J. Hum. Genet. 51 (4): 879–84. ЧВК  1682821. PMID  1415228.
• Гарднер JM, Nakatsu Y, Gondo Y, Lee S, Lyon MF, King RA, Brilliant MH (1992). «Ген разведения розовых глаз мыши: ассоциация с человеческими синдромами Прадера-Вилли и Ангельмана». Наука. 257 (5073): 1121–4. Bibcode:1992Научный ... 257.1121G. Дои:10.1126 / science.257.5073.1121. PMID  1509264. S2CID  5800811.
• Людовез К.Дж., Томпсон К.Дж., Секхон Г.С., Паули Р.М. (1991). «Отсутствие предсказуемой фенотипической экспрессии в проксимальных дупликациях 15q». Clin. Genet. 40 (3): 194–201. Дои:10.1111 / j.1399-0004.1991.tb03076.x. PMID  1773534. S2CID  28419032.
• Ли С.Т., Николс Р.Д., Джонг М.Т., Фукаи К., Спритц Р.А. (1995). «Организация и последовательность человеческого гена Р и идентификация нового семейства транспортных белков». Геномика. 26 (2): 354–63. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80220-G. PMID  7601462.
• Спритц Р.А., Фукаи К., Холмс С.А., Луанде Дж. (1995). «Частая внутригенная делеция гена P у пациентов из Танзании с окулокожным альбинизмом II типа (OCA2)». Am. J. Hum. Genet. 56 (6): 1320–3. ЧВК  1801108. PMID  7762554.
• Ли С.Т., Николлс Р.Д., Шнур Р.Э., Гуида Л.С., Лу-Куо Дж., Спиннер Н.Б., Закай Э.Х., Спритц Р.А. (1994). «Различные мутации гена P среди афроамериканцев с типом II (тирозиназа-положительный) окулокожным альбинизмом (OCA2)». Гм. Мол. Genet. 3 (11): 2047–51. PMID  7874125.
• Дарем-Пьер Д., Гарднер Дж. М., Накацу Ю., Кинг Р. А., Франк Ю, Чинг А., Акварон Р., дель Мармол В., Бриллиант М. Х. (1994). «Африканское происхождение внутригенной делеции гена Р человека при тирозиназа-положительном окулокожном альбинизме». Nat. Genet. 7 (2): 176–9. Дои:10.1038 / ng0694-176. PMID  7920637. S2CID  6185436.
• Ли С.Т., Николлс Р.Д., Бандей С., Лаксова Р., Мусарелла М., Спритц Р.А. (1994). «Мутации гена P при кожно-кожном альбинизме, глазном альбинизме и синдроме Прадера-Вилли плюс альбинизм». N. Engl. J. Med. 330 (8): 529–34. Дои:10.1056 / NEJM199402243300803. PMID  8302318.
• Ринчик Е.М., Бультман С.Дж., Хорстхемке Б., Ли С.Т., Странк К.М., Спритц Р.А., Авидано К.М., Джонг М.Т., Николлс Р.Д. (1993). «Ген локуса разведения розовых глаз мыши и окулокожного альбинизма человека II типа». Природа. 361 (6407): 72–6. Bibcode:1993Натура 361 ... 72р. Дои:10.1038 / 361072a0. PMID  8421497. S2CID  21794972.
• Спритц Р.А., Ли С.Т., Фукаи К., Брондум-Нильсен К., Читаят Д., Липсон М.Х., Мусарелла М.А., Розенманн А., Велебер Р.Г. (1997). «Новые мутации гена P при окулокожном альбинизме II типа (OCA2)». Гм. Мутат. 10 (2): 175–7. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1997) 10: 2 <175 :: AID-HUMU12> 3.0.CO; 2-X. PMID  9259203.
• Керр Р., Стивенс Дж., Манга П., Салм С., Джон П., Хоу Т., Рамзи М. (2000). «Идентификация мутаций гена P у людей с кожно-кожным альбинизмом в Африке к югу от Сахары». Гм. Мутат. 15 (2): 166–72. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <166 :: AID-HUMU5> 3.0.CO; 2-Z. PMID  10649493.
• Оттинг В.С., Гарднер Дж. М., Фрайер Дж. П., Чинг А., Дарем-Пьер Д., Кинг Р. А., Бриллиант М. Х. (1998). «Мутации гена Р человека, связанные с окулокожным альбинизмом II типа (OCA2). Краткое описание мутаций № 205. Онлайн». Гм. Мутат. 12 (6): 434. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 12: 6 <434 :: AID-HUMU16> 3.0.CO; 2-7. PMID  10671067.
• Пассмор Л.А., Кэсманн-Келлнер Б., Вебер Б.Н. (1999). «Новые и повторяющиеся мутации гена тирозиназы и гена P в популяции немецких альбиносов». Гм. Genet. 105 (3): 200–10. Дои:10.1007 / s004390051090. PMID  10987646.
• Манга P, Кромберг Дж, Тернер А, Дженкинс Т, Рамзи М (2001). «В южной части Африки коричневый глазно-кожный альбинизм (BOCA) отображается в локусе OCA2 на хромосоме 15q: выявлены мутации P-гена». Am. J. Hum. Genet. 68 (3): 782–7. Дои:10.1086/318800. ЧВК  1274491. PMID  11179026.
• Манга P, Орлоу SJ (2001). «Обратная корреляция между экспрессией протеина разведения розовых глаз и индукцией меланогенеза бафиломицином A1». Пигментные клетки Res. 14 (5): 362–7. Дои:10.1034 / j.1600-0749.2001.140508.x. PMID  11601658.
• Тойофуку К., Валенсия Дж. К., Кусимото Т., Костин Г. Е., Вирадор В. М., Виейра В. Д., Ферранс В. Дж., Слушание В. Дж. (2002). «Этиология кожно-кожного альбинизма (ОСА) типа II: розовый белок модулирует процессинг и транспорт тирозиназы». Пигментные клетки Res. 15 (3): 217–24. Дои:10.1034 / j.1600-0749.2002.02007.x. PMID  12028586.

внешние ссылки

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о кожно-кожном альбинизме 2 типа