PARP3 - PARP3

PARP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EOC, 3C49, 3C4H, 3CE0, 3FHB, 4GV0, 4GV2, 4GV4, 4L6Z, 4L70, 4L7L, 4L7N, 4L7O, 4L7P, 4L7R, 4L7U
Идентификаторы
Псевдонимы	PARP3, ADPRT3, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD3, IRT1, PADPRT-3, член семейства поли (ADP-рибоза) полимераз 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 607726 MGI: 1891258 ГомолоГен: 4005 Генные карты: PARP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.2 Начинать 51,942,345 бп[1] Конец 51,948,867 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F1 Начинать 106,470,322 бп[2] Конец 106,476,949 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • каталитическая активность • НАД + АДФ-рибозилтрансферазная активность • Активность ДНК-лигазы (АТФ) • активность протеина АДФ-рибозилазы • GO: 0001948 связывание с белками • НАД ДНК АДФ-рибозилтрансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • место двухцепочечного разрыва • центриоль • цитоскелет • ядро клетки • центр организации микротрубочек • ядрышко • хромосома Биологический процесс • локализация белка в месте двухцепочечного разрыва • Лигирование ДНК, участвующее в репарации ДНК • отстающее удлинение прядей • регуляция организации митотического веретена • положительное регулирование лигирования ДНК • поддержание теломер • восстановление двухниточного разрыва • АДФ-рибозилирование белков • Ремонт ДНК • отрицательная регуляция активности обратной транскриптазы теломеразной РНК • поли-АДФ-рибозилирование белков • АДФ-рибозилирование ДНК • отрицательная регуляция переключения изотипа • ауто-АДФ-рибозилирование белков • моно-АДФ-рибозилирование белков • положительное регулирование репарации двухцепочечных разрывов за счет негомологичного соединения концов • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10039	235587
Ансамбль	ENSG00000041880	ENSMUSG00000023249
UniProt	Q9Y6F1	Q3ULW8
RefSeq (мРНК)	NM_001003931 NM_001003935 NM_005485 NM_001370239 NM_001370240	NM_145619 NM_001311150
RefSeq (белок)	NP_001003931 NP_005476 NP_001357168 NP_001357169	NP_001298079 NP_663594
Расположение (UCSC)	Chr 3: 51.94 - 51.95 Мб	Chr 9: 106,47 - 106,48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поли [АДФ-рибоза] полимераза 3 является фермент что у людей кодируется PARP3 ген.^[5][6]

В белок кодируемый этим геном принадлежит к семейству PARP. Эти ферменты изменяют ядерные белки к поли-АДФ-рибозилирование, что требуется для Ремонт ДНК, регулирование апоптоз, и поддержание стабильности генома. Этот ген кодирует поли (АДФ-рибозил) трансферазу 3, локализованную преимущественно в дочерней центриоль на протяжении клеточный цикл. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы были идентифицированы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000041880 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023249 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Йоханссон М. (август 1999 г.). «Семейство генов поли (АДФ-рибозы) полимеразы человека (ADPRTL): клонирование кДНК двух новых гомологов поли (АДФ-рибозы) полимеразы». Геномика. 57 (3): 442–5. Дои:10.1006 / geno.1999.5799. PMID  10329013.
6. «Ген Entrez: семейство поли (АДФ-рибоза) полимераз PARP3, член 3».

дальнейшее чтение

• Башфорд К.Л., Шанс B, Ллойд Д., Пул Р.К. (1981). «Колебания окислительно-восстановительных состояний в синхронно делящихся культурах Acanthamoeba castellanii и Schizosaccharomyces pombe». Биофиз. J. 29 (1): 1–11. Bibcode:1980BpJ .... 29 .... 1B. Дои:10.1016 / S0006-3495 (80) 85114-9. ЧВК  1328658. PMID  7260241.
• Борггрефе Т, Вабл М, Ахмедов АТ, Джессбергер Р (1998). «Комплекс рекомбинации ДНК, специфичный для В-клеток». J. Biol. Chem. 273 (27): 17025–35. Дои:10.1074 / jbc.273.27.17025. PMID  9642267.
• Бергаммер Х, Эбнер М, Маркштейнер Р, Ауэр Б (1999). «pADPRT-2: новый ген полимеризующейся (ADP-рибозил) трансферазы млекопитающих, родственный усеченным гомологам pADPRT у растений и Caenorhabditis elegans». FEBS Lett. 449 (2–3): 259–63. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00448-2. PMID  10338144. S2CID  3251763.
• Тем не менее IH, Винс П., Коуэлл Дж. К. (2000). «Идентификация нового гена (ADPRTL1), кодирующего потенциальный белок поли (ADP-рибозил) трансферазы». Геномика. 62 (3): 533–6. Дои:10.1006 / geno.1999.6024. PMID  10644454.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.3491D. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Glowacki G, Braren R, Cetkovic-Cvrlje M, et al. (2001). «Структура, хромосомная локализация и экспрессия гена эктомоно (АДФ-рибозил) трансферазы ART5 мыши». Ген. 275 (2): 267–77. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00608-4. PMID  11587854.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемой последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Огюстен А., Спенлехауэр С., Дюмон Х. и др. (2004). «PARP-3 локализуется преимущественно в дочерней центриоли и препятствует развитию клеточного цикла G1 / S». J. Cell Sci. 116 (Pt 8): 1551–62. Дои:10.1242 / jcs.00341. PMID  12640039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Rouleau M, McDonald D, Gagné P и др. (2007). «PARP-3 ассоциируется с телами группы поликомб и с компонентами механизма восстановления повреждений ДНК». J. Cell. Биохим. 100 (2): 385–401. Дои:10.1002 / jcb.21051. PMID  16924674. S2CID  25618577.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Лехтио Л., Джемт А.С., Коллинз Р. и др. (2009). «Структурная основа специфичности ингибитора поли (АДФ-рибозы) полимеразы-3 человека». J. Med. Chem. 52 (9): 3108–3111. Дои:10.1021 / jm900052j. PMID  19354255.

внешняя ссылка

• PARP3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• PARP3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.