PLXNA2 - PLXNA2

PLXNA2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3Q3J
Идентификаторы
Псевдонимы	PLXNA2, OCT, PLXN2, плексин A2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601054 MGI: 107684 ГомолоГен: 56427 Генные карты: PLXNA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q32.2 Начинать 208,022,242 бп[1] Конец 208,244,384 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 H6 Начинать 194,618,218 бп[2] Конец 194,816,869 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность рецептора семафорина • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • рецепторный комплекс семафорина • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • сомитогенез • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • тангенциальная миграция предшественников гранулярных клеток мозжечка • ведение аксона жабрдиомоторного нейрона • формирование зачатка конечностей • развитие нервной трубки • семафорин-плексиновый сигнальный путь • преобразование сигнала • развитие глоточной системы • локализация центросомы • регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция клеточной адгезии • регулировка формы клеток • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • положительная регуляция аксоногенеза • сигнальный путь семафорин-плексин, участвующий в ведении аксонов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5362	18845
Ансамбль	ENSG00000076356	ENSMUSG00000026640
UniProt	O75051	P70207
RefSeq (мРНК)	NM_025179	NM_008882
RefSeq (белок)	NP_079455	NP_032908
Расположение (UCSC)	Chr 1: 208.02 - 208.24 Мб	Chr 1: 194,62 - 194,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Плексин-А2 это белок что у людей кодируется PLXNA2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член плексин -Семья семафорин корецепторы. Семафорины - это большое семейство секретируемых или мембраносвязанных белков, которые опосредуют отталкивающее действие на поиск пути аксонов в течение развитие нервной системы. Подмножество семафоринов распознается трансмембранными рецепторными комплексами плексин-А / нейропилин, запуская каскад передачи клеточного сигнала, который приводит к аксон отталкивание. Считается, что этот член семейства плексин-А преобразует сигналы от семафорин-3А и -3С.^[6]

В некоторых исследованиях ген PLXNA2 связан с шизофрения.^[7] и беспокойство.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076356 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026640 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Маэстрини Е., Таманьоне Л., Лонгати П., Кремона О., Гулисано М., Бион С., Таманини Ф., Нил Б. Г., Тониоло Д., Комольо П. М. (март 1996 г.). «Семейство трансмембранных белков, гомологичных рецептору фактора роста гепатоцитов МЕТ». Proc Natl Acad Sci USA. 93 (2): 674–8. Дои:10.1073 / пнас.93.2.674. ЧВК  40111. PMID  8570614.
6. «Энтрез Ген: PLXNA2 плексин А2».
7. Обзор генов всех опубликованных исследований ассоциации шизофрении для PLXNA2 В архиве 2009-02-21 в Wayback Machine - база данных SZGene, сайт Форум по исследованию шизофрении
8. Рэй Н.Р., Джеймс М.Р., Мах С.П., Нельсон М., Эндрюс Г., Салливан П.Ф., Монтгомери Г.В., Бирли А.Дж., Браун А., Мартин Н.Г. (март 2007 г.). «Беспокойство и сопутствующие заболевания, связанные с PLXNA2». Arch. Генеральная психиатрия. 64 (3): 318–26. Дои:10.1001 / archpsyc.64.3.318. PMID  17339520. Архивировано из оригинал на 2009-07-20. Получено 2009-02-11.

дальнейшее чтение

• Негиси М., Ойнума И., Като Х. (2005). «Плексины: ведение аксонов и передача сигналов». Клетка. Мол. Life Sci. 62 (12): 1363–71. Дои:10.1007 / s00018-005-5018-2. PMID  15818466.
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т. и др. (1998). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК Res. 4 (5): 345–9. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID  9455484.
• Tamagnone L, Artigiani S, Chen H и др. (1999). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-закрепленных семафоринов у позвоночных». Клетка. 99 (1): 71–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID  10520995.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белок-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Mah S, Nelson MR, Delisi LE и др. (2006). «Идентификация рецептора семафорина PLXNA2 как кандидата на предрасположенность к шизофрении». Мол. Психиатрия. 11 (5): 471–8. Дои:10.1038 / sj.mp.4001785. PMID  16402134.
• Fujii T, Iijima Y, Kondo H, et al. (2007). «Неспособность подтвердить связь между геном PLXNA2 и шизофренией в популяции Японии». Прог. Neuropsychopharmacol. Биол. Психиатрия. 31 (4): 873–7. Дои:10.1016 / j.pnpbp.2007.01.027. PMID  17346868.