РАНБП3 - RANBP3

РАНБП3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CRF, 2Y8F, 2Y8G
Идентификаторы
Псевдонимы	РАНБП3, RAN-связывающий белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603327 MGI: 1919060 ГомолоГен: 136516 Генные карты: РАНБП3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 5,916,139 бп[1] Конец 5,978,142 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 Д Начинать 56,673,294 бп[2] Конец 56,711,764 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка R-SMAD • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Ran связывание GTPase Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазма • центросома • ядерная пора Биологический процесс • транспорт белка • внутриклеточный транспорт • Экспорт РНК из ядра • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • импорт белка в ядро • GO: 0043146 организация шпинделя • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительная регуляция разделения митотических центросом • G1 / S переход митотического клеточного цикла • экспорт белка из ядра Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8498	71810
Ансамбль	ENSG00000031823	ENSMUSG00000002372
UniProt	Q9H6Z4	Q9CT10
RefSeq (мРНК)	NM_001300865 NM_003624 NM_007320 NM_007321 NM_007322	NM_001252466 NM_001252467 NM_027933
RefSeq (белок)	NP_001287794 NP_003615 NP_015559 NP_015561	NP_001239395 NP_001239396 NP_082209
Расположение (UCSC)	Chr 19: 5.92 - 5.98 Мб	Chr 17: 56.67 - 56.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ран-связывающий белок 3 это белок что у людей кодируется РАНБП3 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок с доменом RanBD1, который находится как в ядре, так и в цитоплазме. Этот белок играет роль в ядерном экспорте как часть гетеромерного комплекса. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

RANBP3 был показан взаимодействовать с RCC1^[5][7] и XPO1.^[8][9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000031823 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002372 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мюллер Л., Кордес В.К., Бишофф Ф.Р., Понстингл Х. (июль 1998 г.). «Человеческий RanBP3, группа ядерных белков, связывающих RanGTP». FEBS Lett. 427 (3): 330–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00459-1. PMID  9637251. S2CID  28405923.
6. «Ген Entrez: RANBP3 RAN-связывающий белок 3».
7. Немергут, Майкл Э; Линдси Марк Е; Браунауэлл Эми М; Macara Ian G (май 2002 г.). «Ran-связывающий белок 3 связывает Crm1 с фактором обмена гуаниновых нуклеотидов Ran». J. Biol. Chem. 277 (20): 17385–8. Дои:10.1074 / jbc.C100620200. ISSN  0021-9258. PMID  11932251.
8. Линдси, М. Э; Holaska J M; Welch K; Paschal B M; Macara I G (июнь 2001 г.). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для Crm1-опосредованного экспорта ядерного белка». J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. Дои:10.1083 / jcb.153.7.1391. ISSN  0021-9525. ЧВК  2150735. PMID  11425870.
9. Линдси, Марк Е; Плафкер Кендра; Смит Алисия Э; Клерман Брюс Э; Macara Ian G (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованный импортин-альфа: бета». Клетка. 110 (3): 349–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X. ISSN  0092-8674. PMID  12176322. S2CID  15515037.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Линдси М.Э., Холаска Дж. М., Уэлч К. и др. (2001). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для Crm1-опосредованного экспорта ядерного белка». J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. Дои:10.1083 / jcb.153.7.1391. ЧВК  2150735. PMID  11425870.
• Энглмайер Л., Форнерод М., Бишофф Ф. Р. и др. (2002). «RanBP3 влияет на взаимодействия между CRM1 и его экспортными субстратами ядерного белка». EMBO Rep. 2 (10): 926–32. Дои:10.1093 / embo-reports / kve200. ЧВК  1084078. PMID  11571268.
• Nemergut ME, Lindsay ME, Brownawell AM, Macara IG (2002). «Ran-связывающий белок 3 связывает Crm1 с фактором обмена гуаниновых нуклеотидов Ran». J. Biol. Chem. 277 (20): 17385–8. Дои:10.1074 / jbc.C100620200. PMID  11932251.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хаката Й, Ямада М, Шида Х (2003). «Многофункциональный домен в CRM1 человека (экспорттин 1) опосредует связывание RanBP3 и мультимеризацию белка Rex вируса Т-клеточного лейкоза человека 1 типа». Мол. Клетка. Биол. 23 (23): 8751–61. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8751-8761.2003. ЧВК  262658. PMID  14612415.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Bibcode:2004Натура.428..529G. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.