RBM12 - RBM12

RBM12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WEL, 2CPY, 2DNN, 2EK1, 2EK6
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM12, HRIHFB2091, SWAN, белок 12, связывающий РНК, SCZD19
Внешние идентификаторы	OMIM: 607179 MGI: 1922960 ГомолоГен: 34993 Генные карты: RBM12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.22 Начинать 35,648,925 бп[1] Конец 35,664,956 бп[1]
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10137	75710
Ансамбль	ENSG00000244462	ENSMUSG00000089824
UniProt	Q9NTZ6	Q8R4X3
RefSeq (мРНК)	NM_152838 NM_001198838 NM_001198840 NM_006047	NM_029397 NM_170598
RefSeq (белок)	NP_001185767 NP_001185769 NP_006038 NP_690051	NP_083673 NP_733486
Расположение (UCSC)	Chr 20: 35.65 - 35.66 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

РНК-связывающий белок 12 это белок что у людей кодируется RBM12 ген.^[4][5]

Этот ген кодирует белок, содержащий несколько РНК -вяжущие мотивы, потенциал трансмембранные домены, и пролин -богатые регионы. Этот ген и ген Копина I перекрываются в местоположении карты 20q11.21. Альтернативная сварка в 5 'UTR приводит к двум вариантам транскрипции. Оба варианта кодируют один и тот же белок.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000244462 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Stover C, Gradl G, Jentsch I, Speicher MR, Wieser R, Schwaeble W. (июль 2001 г.). «Клонирование кДНК, определение хромосом и геномная структура гена человека, кодирующего нового члена семейства RBM». Cytogenet Cell Genet. 92 (3–4): 225–30. Дои:10.1159/000056908. PMID  11435693. S2CID  20555964.
5. «Ген Entrez: белок 12 РНК-связывающего мотива RBM12».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Кофлер М, Моцны К., Фройнд С (2006). «Протеомика домена GYF выявляет сайты взаимодействия в известных и новых целевых белках». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (11): 1797–811. Дои:10.1074 / mcp.M500129-MCP200. PMID  16120600.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
• Уэки Н., Ода Т., Кондо М. и др. (1999). «Система отбора генов, кодирующих белки с ядерной мишенью». Nat. Биотехнология. 16 (13): 1338–42. Дои:10.1038/4315. PMID  9853615. S2CID  20001769.

внешняя ссылка

• RBM12 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• RBM12 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.