SERBP1 - SERBP1

SERBP1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4V6X
Идентификаторы
Псевдонимы	SERBP1, CHD3IP, HABP4L, PAI-RBP1, PAIRBP1, CGI-55, мРНК-связывающий белок 1 SERPINE1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607378 MGI: 1914120 ГомолоГен: 134277 Генные карты: SERBP1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	67,430,415 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание мРНК 3'-UTR; • Связывание РНК; • связывание кадгерина; • SUMO привязка;
Сотовый компонент	• перинуклеарная область цитоплазмы; • клеточная мембрана; • внеклеточная экзосома; • мембрана; • цитозоль; • ядро клетки; • цитоплазма;
Биологический процесс	• регуляция апоптотического процесса; • регуляция стабильности мРНК; • Организация тела PML;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	26135
	66870
	ENSG00000142864
	ENSMUSG00000036371
	Q8NC51
	Q9CY58
	NM_015640; NM_001018067; NM_001018068; NM_001018069
	NM_001113564; NM_001113565; NM_001113566; NM_025814
	NP_001018077; NP_001018078; NP_001018079; NP_056455
	NP_001107036; NP_001107037; NP_001107038; NP_080090
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Ингибитор активатора плазминогена 1 РНК-связывающий белок (serbp1) - это белок что у людей кодируется SERBP1 ген.^[4]^[5]^[6]

Взаимодействия

SERBP1 был показан взаимодействовать с участием CHD3.^[7]^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142864 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Хитон Дж. Х., Длакич В. М., Длакич М., Гелехртер Т. Д. (май 2001 г.). «Идентификация и клонирование кДНК нового РНК-связывающего белка, который взаимодействует с циклической нуклеотидной последовательностью в мРНК ингибитора активатора плазминогена типа 1». J Biol Chem. 276 (5): 3341–7. Дои:10.1074 / jbc.M006538200. PMID 11001948.
^ Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК 310876. PMID 10810093.
^ «Ген Entrez: мРНК-связывающий белок 1 SERBP1 SERPINE1».
^ Лемос Т.А., Пассос Д.О., Нери ФК, Кобарг Дж. (Январь 2003 г.). «Характеристика нового семейства белков, которые взаимодействуют с С-концевой областью фактора ремоделирования хроматина CHD-3». FEBS Lett. Нидерланды. 533 (1–3): 14–20. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03737-7. ISSN 0014-5793. PMID 12505151.
^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. Соединенные Штаты. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. ISSN 0092-8674. PMID 16169070.

дальнейшее чтение

Маруяма К; Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Bucková D; Izakovicová Hollá L; Вача Дж (2002). «Полиморфизм 4G / 5G в гене ингибитора активатора плазминогена-1 (PAI-1) связан с IgE-опосредованными аллергическими заболеваниями и астмой в чешской популяции». Аллергия. 57 (5): 446–8. Дои:10.1034 / j.1398-9995.2002.03582.x. PMID 11972486.
Джонс К., Пауэлл Дж, Браун Л. и др. (2002). «Влияние полиморфизма 4G / 5G в промоторе гена ингибитора-1 активатора плазминогена на частоту, рост и операционный риск аневризмы брюшной аорты». Европейский журнал сосудистой и эндоваскулярной хирургии. 23 (5): 421–5. Дои:10.1053 / ejvs.2002.1633. PMID 12027469.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Lemos TA; Passos DO; Нери ФК; Кобарг Дж (2003). «Характеристика нового семейства белков, которые взаимодействуют с С-концевой областью фактора ремоделирования хроматина CHD-3». FEBS Lett. 533 (1–3): 14–20. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03737-7. PMID 12505151.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Lemos TA; Кобарг Дж. (2006). «CGI-55 взаимодействует с ядерными белками и совместно локализуется в тельцах с положительной спиралью p80-коилина в ядре». Cell Biochem. Биофизы. 44 (3): 463–74. Дои:10.1385 / CBB: 44: 3: 463. PMID 16679534.
Passos DO; Bressan GC; Нери ФК; Кобарг Дж. (2006). «Ki-1/57 взаимодействует с PRMT1 и является субстратом для метилирования аргинина». FEBS J. 273 (17): 3946–61. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2006.05399.x. PMID 16879614.
Dalmáz CA, Santos KG, Botton MR, et al. (2006). «Взаимосвязь между полиморфизмами тромбофильных генов и преэклампсией в бразильской популяции». Blood Cells Mol. Дис. 37 (2): 107–10. Дои:10.1016 / j.bcmd.2006.07.005. PMID 16963292.
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.
Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q8NC51 (РНК-связывающий белок ингибитора активатора плазминогена 1) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142864 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11001948-4] Хитон Дж. Х., Длакич В. М., Длакич М., Гелехртер Т. Д. (май 2001 г.). «Идентификация и клонирование кДНК нового РНК-связывающего белка, который взаимодействует с циклической нуклеотидной последовательностью в мРНК ингибитора активатора плазминогена типа 1». J Biol Chem. 276 (5): 3341–7. Дои:10.1074 / jbc.M006538200. PMID 11001948.

[pmid10810093-5] Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК 310876. PMID 10810093.

[entrez-6] «Ген Entrez: мРНК-связывающий белок 1 SERBP1 SERPINE1».

[pmid12505151-7] Лемос Т.А., Пассос Д.О., Нери ФК, Кобарг Дж. (Январь 2003 г.). «Характеристика нового семейства белков, которые взаимодействуют с С-концевой областью фактора ремоделирования хроматина CHD-3». FEBS Lett. Нидерланды. 533 (1–3): 14–20. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03737-7. ISSN 0014-5793. PMID 12505151.

[pmid16169070-8] Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. Соединенные Штаты. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. ISSN 0092-8674. PMID 16169070.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]