SFSWAP - SFSWAP

SFSWAP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2E5Z, 2Э60
Идентификаторы
Псевдонимы	SFSWAP, SFRS8, SWAP, гомолог фактора сплайсинга SWAP, фактор сплайсинга SWAP
Внешние идентификаторы	OMIM: 601945 MGI: 101760 ГомолоГен: 134548 Генные карты: SFSWAP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.33 Начинать 131,711,081 бп[1] Конец 131,799,737 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G1.3 Начинать 129,501,221 бп[2] Конец 129,571,384 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • обработка мРНК • Обработка РНК • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • альтернативный сплайсинг мРНК через сплайсосомы • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК • Распознавание сайта 5'-сплайсинга мРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6433	231769
Ансамбль	ENSG00000061936	ENSMUSG00000029439
UniProt	Q12872	Q3USH5
RefSeq (мРНК)	NM_001261411 NM_004592 NM_152235	NM_001035259 NM_172276 NM_001359952 NM_001378915 NM_001378916 NM_001378917
RefSeq (белок)	NP_001248340 NP_004583	NP_758480 NP_001346881 NP_001365844 NP_001365845 NP_001365846
Расположение (UCSC)	Chr 12: 131,71 - 131,8 Мб	Chr 5: 129,5 - 129,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга, подавитель гомолога бело-абрикосового это белок у людей, который кодируется SFSWAP ген.^[5]

Этот ген кодирует человеческий гомолог Дрозофила регуляторный белок сплайсинга. Этот ген саморегулирует свою экспрессию, контролируя сплайсинг первых двух интроны. Кроме того, он также регулирует сращивание фибронектин и CD45 гены. Идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000061936 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029439 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор сплайсинга, супрессор гомолога белого абрикоса (Drosophila)». Получено 2013-05-08.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для фактора сплайсинга человека, подавителя гомолога белого абрикоса (SFSWAP)