SH3PXD2A - SH3PXD2A

SH3PXD2A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DNU, 2EGA, 2EGC, 2EKH
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3PXD2A, FISH, SH3MD1, TKS5, SH3 и домены PX 2A
Внешние идентификаторы	MGI: 1298393 ГомолоГен: 7317 Генные карты: SH3PXD2A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q24.33 Начинать 103,594,027 бп[1] Конец 103,855,543 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C3 Начинать 47,260,174 бп[2] Конец 47,464,401 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • супероксид-генерирующая активность активатора НАДФН-оксидазы • связывание фосфатидилинозита • связывание протеазы • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • связывание фосфатидилинозитол-5-фосфата • связывание фосфатидилинозитол-3-фосфата • связывание фосфатидилинозитол-3,4-бисфосфата • фосфатидилинозитол-4-фосфатное связывание Сотовый компонент • цитоплазма • подосомы • соединение клеток • проекция клетки • цитозоль Биологический процесс • слияние остеокластов • супероксидный метаболический процесс • метаболический процесс активных форм кислорода • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • окислительно-восстановительный процесс • сборка подосомы • организация внеклеточного матрикса Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9644	14218
Ансамбль	ENSG00000107957	ENSMUSG00000053617
UniProt	Q5TCZ1	O89032
RefSeq (мРНК)	NM_014631 NM_001365079	NM_001164717 NM_008018 NM_177833
RefSeq (белок)	NP_055446 NP_001352008	NP_001158189 NP_032044
Расположение (UCSC)	Chr 10: 103,59 - 103,86 Мб	Chr 19: 47,26 - 47,46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SH3- и PX-домен, содержащий белок 2A это белок что у людей кодируется SH3PXD2A ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107957 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053617 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лок П., Абрам С.Л., Гибсон Т., Кортнидж С.А. (сентябрь 1998 г.). «Новый метод выделения субстратов тирозинкиназы, используемый для идентификации рыб, белка, содержащего SH3- и PX-домен, и субстрата Src». EMBO J. 17 (15): 4346–57. Дои:10.1093 / emboj / 17.15.4346. ЧВК  1170768. PMID  9687503.
6. «Ген Entrez: SH3PXD2A, SH3 и PX домены 2A».

дальнейшее чтение

• Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID  9455477.
• Abram CL, Seals DF, Pass I, et al. (2003). «Адаптерный белок рыбы ассоциируется с членами семейства ADAM и локализуется в подосомах Src-трансформированных клеток». J. Biol. Chem. 278 (19): 16844–51. Дои:10.1074 / jbc.M300267200. PMID  12615925.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Силы DF, Azucena EF, Pass I и др. (2005). «Адаптерный белок Tks5 / Fish необходим для образования и функционирования подосом, а также для управляемой протеазой инвазии раковых клеток». Раковая клетка. 7 (2): 155–65. Дои:10.1016 / j.ccr.2005.01.006. PMID  15710328.
• Малинин Н.Л., Райт С., Зеуберт П. и др. (2005). «Нейротоксичность амилоида-бета опосредована адаптерным белком FISH и активностью металлопротеазы ADAM12». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (8): 3058–63. Дои:10.1073 / pnas.0408237102. ЧВК  549444. PMID  15710903.
• Гарольд Д., Джеху Л., Турик Д. и др. (2007). «Взаимодействие между генами ADAM12 и SH3MD1 может привести к предрасположенности к болезни Альцгеймера с поздним началом». Являюсь. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 144 (4): 448–52. Дои:10.1002 / ajmg.b.30456. PMID  17440933. S2CID  13922599.