Растение с малой ядрышковой РНК snoR9 - Small nucleolar RNA snoR9 plant

Малая ядрышковая РНК snoR9
snoR9_plant
Идентификаторы
СимволsnoR9_plant
РфамRF00348
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; гид; CD-бокс;
PDB структурыPDBe

snoR9 это некодирующая РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Он известен как малая ядрышковая РНК (мяРНК), которую также часто называют «направляющей РНК».

R9 является членом C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

Эта растительная мяРНК была идентифицирована в Arabidopsis thaliana путем компьютерного скрининга и экспериментально подтвержден анализом удлинения праймера.[2] Эта snoRNA не связана с snoRNA, идентифицированной в гипертермофилы также называемый snoR9.

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Барнече Ф., Гаспин С., Гайот Р., Эчеверрия М. (2001). "Идентификация 66 бокс-C / D snoRNAs в Arabidopsis thaliana: обширные дупликации генов привели к появлению множества изоформ, предсказывающих новые сайты 2'-O-метилирования рибосомальной РНК ». J. Mol. Биол. 311 (1): 57–73. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4851. PMID  11469857.

внешняя ссылка