TERF2IP - TERF2IP

TERF2IP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1FEX, 3K6G, 4RQI
Идентификаторы
Псевдонимы	TERF2IP, DRIP5, RAP1, TERF2 взаимодействующий белок
Внешние идентификаторы	OMIM: 605061 MGI: 1929871 ГомолоГен: 10357 Генные карты: TERF2IP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q23.1 Начните 75,647,773 бп[1] Конец 75,761,872 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 E1 Начните 112,011,398 бп[2] Конец 112,020,528 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание теломерной ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание G-богатой цепи теломерной ДНК • связывание фосфатазы Сотовый компонент • комплекс ядерных теломер • ядерная оболочка • хромосома • Шелтерин • хромосома, теломерная область • ядерная хромосома • Комплекс МРЭ11 • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • ядерное тело • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция рекомбинации ДНК на теломерах • поддержание теломер через теломеразу • защита от негомологичного сращивания концов на теломерах • регуляция репарации двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • локализация белка в хромосоме, теломерной области • положительное регулирование ацетилирования белков • поддержание теломер через удлинение теломер • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • поддержание теломер • покрытие теломер • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция поддержания теломер • отрицательная регуляция поддержания теломер • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	54386	57321
Ансамбль	ENSG00000166848	ENSMUSG00000033430
UniProt	Q9NYB0	Q91VL8
RefSeq (мРНК)	NM_018975	NM_020584
RefSeq (белок)	NP_061848	NP_065609
Расположение (UCSC)	Chr 16: 75.65 - 75.76 Мб	Chr 8: 112.01 - 112.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор связывания теломерного повтора 2, взаимодействующий с белком 1 это белок что у людей кодируется TERF2IP ген.^[5][6]

Взаимодействия

TERF2IP был показан взаимодействовать с Ku80,^[7] Rad50^[7] и TERF2.^[5][7][8] Было показано, что при взаимодействии комплекс TERF2IP / TERF2 связывается с сайтами теломерных соединений с более высоким сродством.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166848 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033430 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли Б., Эстрайх С., де Ланге Т. (май 2000 г.). «Идентификация человеческого Rap1: значение для эволюции теломер». Ячейка. 101 (5): 471–83. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80858-2. PMID  10850490. S2CID  7956545.
6. «Ген Entrez: фактор связывания 2 теломерных повторов TERF2IP, взаимодействующий белок».
7. О'Коннор М.С., Safari A, Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс человека Rap1 и модуляция длины теломер». Журнал биологической химии. 279 (27): 28585–91. Дои:10.1074 / jbc.M312913200. PMID  15100233.
8. Чжу XD, Кюстер Б., Манн М., Петрини Дж. Х., де Ланге Т. (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50 / MRE11 / NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природа Генетика. 25 (3): 347–52. Дои:10.1038/77139. PMID  10888888. S2CID  6689794.
9. Arat NÖ, Griffith JD (декабрь 2012 г.). «Человеческий Rap1 непосредственно взаимодействует с теломерной ДНК и регулирует локализацию TRF2 на теломере». Журнал биологической химии. 287 (50): 41583–94. Дои:10.1074 / jbc.M112.415984. ЧВК  3516710. PMID  23086976.

дальнейшее чтение

• Чжу XD, Кюстер Б., Манн М., Петрини Дж. Х., де Ланге Т. (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50 / MRE11 / NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природа Генетика. 25 (3): 347–52. Дои:10.1038/77139. PMID  10888888. S2CID  6689794.
• Ханаока С., Нагадои А., Йошимура С., Аймото С., Ли Б., де Ланге Т., Нисимура И. (сентябрь 2001 г.). «ЯМР-структура мотива hRap1 Myb выявляет канонический трехспиральный пучок, в котором отсутствует положительный поверхностный заряд, типичный для ДНК-связывающих доменов Myb». Журнал молекулярной биологии. 312 (1): 167–75. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4924. PMID  11545594.
• Лоайза Д., Де Ланге Т. (июнь 2003 г.). «POT1 как конечный преобразователь контроля длины теломер TRF1». Природа. 423 (6943): 1013–8. Bibcode:2003Натура 423.1013Л. Дои:10.1038 / природа01688. PMID  12768206. S2CID  4370276.
• Ли Б., де Ланге Т. (декабрь 2003 г.). «Rap1 влияет на длину и неоднородность теломер человека». Молекулярная биология клетки. 14 (12): 5060–8. Дои:10.1091 / mbc.E03-06-0403. ЧВК  284807. PMID  14565979.
• Zhu XD, Niedernhofer L, Kuster B, Mann M, Hoeijmakers JH, de Lange T (декабрь 2003 г.). «ERCC1 / XPF удаляет 3'-выступ от незащищенных теломер и подавляет образование теломерных ДНК-содержащих двойных минутных хромосом». Молекулярная клетка. 12 (6): 1489–98. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00478-7. PMID  14690602.
• О'Коннор М.С., Safari A, Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс человека Rap1 и модуляция длины теломер». Журнал биологической химии. 279 (27): 28585–91. Дои:10.1074 / jbc.M312913200. PMID  15100233.
• Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Лэгелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию в теломерах». Природа клеточной биологии. 6 (7): 673–80. Дои:10.1038 / ncb1142. PMID  15181449. S2CID  11543383.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Ye JZ, Donigian JR, van Overbeek M, Loayza D, Luo Y, Krutchinsky AN, Chait BT, de Lange T (ноябрь 2004 г.). «TIN2 связывает TRF1 и TRF2 одновременно и стабилизирует комплекс TRF2 на теломерах». Журнал биологической химии. 279 (45): 47264–71. Дои:10.1074 / jbc.M409047200. PMID  15316005.
• Лю Д., О'Коннор М.С., Цинь Дж., Сунъян З. (декабрь 2004 г.). «Телосома, комплекс, связанный с теломерами млекопитающих, образованный множеством теломерных белков». Журнал биологической химии. 279 (49): 51338–42. Дои:10.1074 / jbc.M409293200. PMID  15383534.
• Ван Д, Гун И, Цинь В, Чжан П, Ли Дж, Вэй Л, Чжоу Х, Ли Х, Цю Х, Чжун Ф, Хэ Л, Ю Дж, Яо Г, Цзян Х, Цянь Л, Ю Й, Шу Х , Чен X, Сюй Х, Го М., Пан З, Чен И, Ге Ц, Ян С., Гу Дж (ноябрь 2004 г.). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (44): 15724–9. Bibcode:2004PNAS..10115724W. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Антуан К., Фербус Д., Колахгар Г., Проспери М. Т., Губен Г. (июль 2005 г.). «Белок цинкового пальца, сверхэкспрессируемый при карциноме толстой кишки, взаимодействует с теломерным белком hRap1». Журнал клеточной биохимии. 95 (4): 763–8. Дои:10.1002 / jcb.20487. PMID  15838871. S2CID  10264323.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Ву И, Закал, Нью-Джерси, Радуга А.Дж., Чжу XD (февраль 2007 г.). «XPF с мутациями в его консервативном нуклеазном домене дефектен в отношении репарации ДНК, но функционирует в TRF2-опосредованном укорочении теломер». Ремонт ДНК. 6 (2): 157–66. Дои:10.1016 / днареп.2006.09.005. PMID  17055345.
• Бэ Н.С., Бауманн П. (май 2007 г.). «Комплекс RAP1 / TRF2 ингибирует негомологичное соединение концов на концах теломерной ДНК человека». Молекулярная клетка. 26 (3): 323–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.03.023. PMID  17499040.