UTP20 - UTP20

UTP20
Идентификаторы
Псевдонимы	UTP20, DRIM, 1A6 / DRIM, компонент процессома малой субъединицы, компонент процессома малой субъединицы UTP20
Внешние идентификаторы	OMIM: 612822 MGI: 1917933 ГомолоГен: 38373 Генные карты: UTP20
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q23.2 Начните 101,280,105 бп[1] Конец 101,386,618 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C1 Начните 88,746,607 бп[2] Конец 88,826,804 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • прерибосома, предшественник малых субъединиц • процессом малых субъединиц • ядрышко • ядро клетки • Прерибосома 90S • нуклеоплазма • клеточная мембрана Биологический процесс • эндонуклеолитическое расщепление в 5'-ETS транскрипта трицистронной рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • эндонуклеолитическое расщепление с образованием зрелого 5'-конца SSU-рРНК из (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • эндонуклеолитическое расщепление в ITS1 для отделения SSU-рРНК от 5.8S рРНК и LSU-рРНК от транскрипта трицистронной рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • отрицательное регулирование пролиферации клеток • созревание SSU-рРНК из транскрипта трицистронной рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • обработка рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27340	70683
Ансамбль	ENSG00000120800	ENSMUSG00000004356
UniProt	O75691	Q5XG71
RefSeq (мРНК)	NM_014503	NM_175158
RefSeq (белок)	NP_055318	NP_780367
Расположение (UCSC)	Chr 12: 101.28 - 101.39 Мб	Chr 10: 88,75 - 88,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог компонента 20 процессома малой субъединицы это белок что у людей кодируется UTP20 ген.^[5][6][7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120800 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004356 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Schwirzke M, Gnirke A, Bork P, Tarin D, Weidle UH (август 1998 г.). «Дифференциальная экспрессия генов в клеточных линиях карциномы молочной железы: идентификация DRIM, нового гена, подавляемого при метастазировании». Противораковый Res. 18 (3A): 1409–21. PMID  9673349.
6. Бернштейн К.А., Галлахер Дж. Э., Митчелл Б. М., Граннеман С., Басерга С. Дж. (Декабрь 2004 г.). «Процессом малых субъединиц является промежуточным звеном сборки рибосом». Эукариотическая клетка. 3 (6): 1619–26. Дои:10.1128 / EC.3.6.1619-1626.2004. ЧВК  539036. PMID  15590835.
7. Пэн В.Т., Робинсон, доктор медицины, Мнаимне С., Кроган Н.Дж., Кэгни Дж., Моррис К., Давиервала А.П., Григулл Дж., Ян Х, Чжан В., Мицакакис Н., Райан О.В., Датта Н., Джоджик В., Пал С., Канадиен В., Ричардс Д. , Beattie B, Wu LF, Altschuler SJ, Roweis S, Frey BJ, Emili A, Greenblatt JF, Hughes TR (июль 2003 г.). «Панорамный вид обработки некодирующей РНК дрожжей». Клетка. 113 (7): 919–33. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00466-5. PMID  12837249. S2CID  10190539.
8. «Ген Entrez: UTP20 UTP20, малая субъединица (SSU), компонент процессома, гомолог (дрожжи)».

дальнейшее чтение

• Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Булт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Е.Ф., Вайншток К.Г., Гокейн Д.Д., Уайт О. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Шерл А., Коуте Й, Деон С., Калле А., Киндбайтер К., Санчес Дж. К., Греко А., Хохштрассер Д., Диас Дж. Дж. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Гудисон С., Виарс С., Граццини М., Уркиди В. (2004). «Взаимосвязь между экспрессией гена DRIM и цитогенетическими и фенотипическими характеристиками в линиях клеток опухоли груди человека». BMC Genomics. 4 (1): 39. Дои:10.1186/1471-2164-4-39. ЧВК  222913. PMID  14503924.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Xing X, Du X, Lu Z, Ning T, Su X, Ke Y (2005). «Характеристика промотора 1A6 / DRIM, нового гена, связанного с раком, и идентификация его активатора транскрипции». Ген. 344: 161–9. Дои:10.1016 / j.gene.2004.09.036. PMID  15656982.
• Ян Л., Чжао Дж, Люй В, Ли И, Ду Икс, Нин Т, Лу Г, Ке И (2006). «KIAA0649, 1A6 / DRIM-взаимодействующий белок с онкогенным потенциалом». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 334 (3): 884–90. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.179. PMID  16053918.
• Лю Дж, Ду Икс, Ке И (2006). «Картирование нуклеолярных последовательностей локализации 1A6 / DRIM». FEBS Lett. 580 (5): 1405–10. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.01.064. PMID  16458307. S2CID  29337295.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Ван Й, Лю Дж, Чжао Х, Люй В, Чжао Дж, Ян Л, Ли Н, Ду Х, Кэ Y (2007). «Человеческий 1A6 / DRIM, гомолог дрожжевого Utp20, участвует в процессинге 18S рРНК». Биохим. Биофиз. Acta. 1773 (6): 863–8. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2007.04.002. PMID  17498821.