VRK2 - VRK2

VRK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2V62
Идентификаторы
Псевдонимы	VRK2, родственная осповакцина киназа 2, VRK серин / треонинкиназа 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602169 MGI: 1917172 ГомолоГен: 55966 Генные карты: VRK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п16.1 Начинать 57,907,629 бп[1] Конец 58,159,920 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A3.3 Начинать 26,471,322 бп[2] Конец 26,593,999 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • специфическое связывание белкового домена • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание протеинкиназы Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • митохондриальные мембраны • мембрана • эндоплазматический ретикулум • митохондрия • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регулирование каскада МАПК • регуляция опосредованного интерлейкином-1 сигнального пути • фосфорилирование • фосфорилирование белков • фосфорилирование пептидил-серина • аутофосфорилирование • клеточный ответ на окислительный стресс • GO: 0022415 вирусный процесс • регулировка формы клеток • фосфорилирование пептидил-треонина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7444	69922
Ансамбль	ENSG00000028116	ENSMUSG00000064090
UniProt	Q86Y07	Q8BN21
RefSeq (мРНК)	NM_001130480 NM_001130481 NM_001130482 NM_001130483 NM_001288836 NM_001288837 NM_001288838 NM_001288839 NM_006296	NM_001252447 NM_027260
RefSeq (белок)	NP_001123952 NP_001123953 NP_001123954 NP_001123955 NP_001275765 NP_001275766 NP_001275767 NP_001275768 NP_006287	NP_001239376 NP_081536
Расположение (UCSC)	Chr 2: 57.91 - 58.16 Мб	Chr 11: 26,47 - 26,59 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинкиназа VRK2 является фермент что у людей кодируется VRK2 ген.^[5]

Этот ген кодирует член вакцина семейство киназ (VRK) серин / треонинового белка киназы. Этот ген широко экспрессируется в тканях человека и имеет повышенную экспрессию в активно делящихся клетках, таких как клетки яички, лейкоциты, печень плода и карциномы. Его белок локализуется в эндоплазматический ретикулум и было показано фосфорилировать казеин и пройти аутофосфорилирование.

Хотя для этого гена может существовать несколько вариантов транскрипта, на сегодняшний день биологически подтверждена полноценная природа только одного.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000028116 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064090 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: VRK2, родственная киназа 2 осповакцины».

дальнейшее чтение

• Бланко С., Сантос С., Лазо, Пенсильвания (2008). «Киназа 2, родственная осповакцине, модулирует стрессовую реакцию на гипоксию, опосредованную TAK1». Мол. Клетка. Биол. 27 (20): 7273–83. Дои:10.1128 / MCB.00025-07. ЧВК  2168905. PMID  17709393.
• Ли ЛИ, Лю М.Ю., Ши Х.М. и др. (2006). «Клеточный белок человека VRK2 специфически взаимодействует с вирусом Эпштейна-Барра BHRF1, гомологом Bcl-2, и увеличивает выживаемость клеток». J. Gen. Virol. 87 (Пт 10): 2869–78. Дои:10.1099 / vir.0.81953-0. PMID  16963744.
• Blanco S, Klimcakova L, Vega FM, Lazo PA (2006). «Субклеточная локализация изоформ киназы-2, родственной осповакцины (VRK2), определяет их различное влияние на стабильность p53 в линиях опухолевых клеток». FEBS J. 273 (11): 2487–504. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2006.05256.x. HDL:10261/7155. PMID  16704422. S2CID  6110354.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Николс Р.Дж., Трактман П. (2004). «Характеристика трех паралоговых членов семейства киназ, родственных осповакцине млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (9): 7934–46. Дои:10.1074 / jbc.M310813200. PMID  14645249.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Незу Дж, Оку А, Джонс М.Х., Шиманэ М. (1998). «Идентификация двух новых предполагаемых серин / треониновых киназ человека, VRK1 и VRK2, со структурным сходством с киназой B1R вируса осповакцины». Геномика. 45 (2): 327–31. Дои:10.1006 / geno.1997.4938. PMID  9344656.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.