CDY1 - CDY1

CDY1
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2FBM
Идентификаторы
Псевдонимы	CDY1, CDY, CDY1A, белок хромодомена, Y-связанный, 1, хромодоменный Y-связанный 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 400016 ГомолоГен: 36165 Генные карты: CDY1
Генная онтология Молекулярная функция • активность гистонацетилтрансферазы • связывание метилированного гистона • трансферазная активность • трансферазная активность, перенос ацильных групп • каталитическая активность • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • ацетилирование гистонов • метаболизм • сперматогенез • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9085	н / д
Ансамбль	ENSG00000172288	н / д
UniProt	Q9Y6F8	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_004680 NM_170723	н / д
RefSeq (белок)	NP_004671 NP_733841	н / д
Расположение (UCSC)	н / д	н / д
PubMed поиск	[1]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Яичко-специфический хромодоменный белок Y 1 это белок что у людей кодируется CDY1 ген.^[2][3]

Этот ген кодирует белок, содержащий хромодомен и каталитический домен гистонацетилтрансферазы. Хромодоменные белки являются компонентами гетерохроматиноподобных комплексов и могут действовать как репрессоры генов. Этот белок локализован в ядре поздних сперматид, где происходит гиперацетилирование гистонов. Считается, что гиперацетилирование гистонов облегчает переход, при котором протамины заменяют гистоны в качестве основного белка, упаковывающего ДНК. В хромосоме Y человека есть две идентичные копии этого гена в палиндромной области; эта запись представляет собой более теломерную копию. Хромосома Y также содержит пару близкородственных генов в другом, более теломерном палиндроме, а также несколько родственных псевдогенов. Две изоформы белка кодируются вариантами транскрипта этого гена. Были описаны дополнительные варианты транскриптов, но их полноразмерный характер не определен.^[3] Считается, что ген связан с высотная адаптация человека.^[4]

Рекомендации

1. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
2. Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (ноябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука. 278 (5338): 675–80. Bibcode:1997Sci ... 278..675L. Дои:10.1126 / наука.278.5338.675. PMID  9381176.
3. «Ген Entrez: хромодоменный белок CDY1, Y-связанный, 1».
4. Чжан Ю.Б., Ли Х, Чжан Ф., Ван Д.М., Ю Дж. (2012). «Предварительное исследование изменения количества копий у тибетцев». PLOS ONE. 7 (7): e41768. Bibcode:2012PLoSO ... 741768Z. Дои:10.1371 / journal.pone.0041768. ЧВК  3402393. PMID  22844521.

внешняя ссылка

• Человек CDY1 расположение генома и CDY1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Джонс Д.О., Коуэлл И.Г., Сингх П.Б. (2000). «Белки хромодомена млекопитающих: их роль в организации и экспрессии генома». BioEssays. 22 (2): 124–37. CiteSeerX  10.1.1.575.6410. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-1878 (200002) 22: 2 <124 :: AID-BIES4> 3.0.CO; 2-E. PMID  10655032.
• Йен PH (1999). «Дальняя рестрикционная карта интервала делеции 6 Y-хромосомы человека: область, часто удаляемая у самцов с азооспермией». Геномика. 54 (1): 5–12. Дои:10.1006 / geno.1998.5526. PMID  9806824.
• Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (1999). «Ретропозиция аутосомной мРНК дала семя генов, специфичных для семенников, на Y-хромосоме человека». Nat. Genet. 21 (4): 429–33. Дои:10.1038/7771. PMID  10192397. S2CID  8345990.
• Саут Н., Терриу П., Наварро А. и др. (2000). «Гены Y-хромосомы человека BPY2, CDY1 и DAZ не важны для поддержания фертильности». Мол. Гм. Репрод. 6 (9): 789–93. Дои:10,1093 / моль · ч / 6,9,789. PMID  10956550.
• Клейман С.Е., Лагзил А., Йогев Л. и др. (2001). «Экспрессия CDY1 может идентифицировать полный сперматогенез». Fertil. Стерил. 75 (1): 166–73. Дои:10.1016 / S0015-0282 (00) 01639-3. PMID  11163833.
• Ферлин А., Моро Е., Росси А., Фореста С. (2001). «Анализ CDY1 у бесплодных пациентов с делециями DAZ». J. Endocrinol. Вкладывать деньги. 24 (2): RC4–6. Дои:10.1007 / bf03343814. PMID  11263480. S2CID  22500357.
• Лан Б.Т., Тан З.Л., Чжоу Дж. И др. (2002). «Ранее не охарактеризованные гистонацетилтрансферазы, участвующие в сперматогенезе млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (13): 8707–12. Bibcode:2002PNAS ... 99.8707L. Дои:10.1073 / pnas.082248899. ЧВК  124363. PMID  12072557.
• Костова Е., Рёттгер С., Шемпп В., Громолл Дж. (2003). «Идентификация и характеристика хромодомена гена cynCDY яванского макака, ортолога семейства генов CDY человека». Мол. Гм. Репрод. 8 (8): 702–9. Дои:10,1093 / моль · ч / 8,8,702. PMID  12149400.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Скалецкий Х., Курода-Кавагути Т., Минкс П.Дж. и др. (2003). «Специфическая для мужчин область Y-хромосомы человека представляет собой мозаику классов дискретных последовательностей». Природа. 423 (6942): 825–37. Bibcode:2003Натура.423..825С. Дои:10.1038 / природа01722. PMID  12815422.
• Дорус С., Гилберт С.Л., Форстер М.Л. и др. (2003). «Семейство генов, связанных с CDY: скоординированная эволюция числа копий, профиля экспрессии и последовательности белка». Гм. Мол. Genet. 12 (14): 1643–50. Дои:10.1093 / hmg / ddg185. PMID  12837688.
• Клейман С.Е., Йогев Л., Хаузер Р. и др. (2003). «Члены семейства CDY имеют разные паттерны экспрессии: транскрипты CDY1 имеют наилучшую корреляцию с полным сперматогенезом». Гм. Genet. 113 (6): 486–92. Дои:10.1007 / s00439-003-0990-9. PMID  14569460. S2CID  43221279.