Разделение сайта - Segregating site

Разделение сайтов позиции, которые показывают различия (полиморфизмы ) между родственными генами в выравнивание последовательностей (не консервированный ).[1] Сайты разделения включают консервативный, полуконсервативные и неконсервативные мутации.

Доля сегрегационных сайтов в гене является важной статистикой в популяционная генетика поскольку его можно использовать для оценки скорость мутации при условии, что нет отбор. Например, он используется для расчета Таджима D нейтральная статистика эволюции.

А выравнивание последовательностей, произведено ClustalO, млекопитающих гистон белки.
Последовательности аминокислоты для остатков 120-180 белков. Остатки, которые сохраняются во всех последовательностях, выделены серым цветом. Ниже белковых последовательностей находится ключ, обозначающий консервативная последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) и неконсервативные мутации ().[2]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Fu, YX (октябрь 1995 г.). «Статистические свойства сегрегационных сайтов». Теоретическая популяционная биология. 48 (2): 172–97. Дои:10.1006 / tpbi.1995.1025. PMID  7482370.
  2. ^ "Часто задаваемые вопросы по Clustal # Символы". Clustal. Получено 8 декабря 2014.