CDK5RAP2 - CDK5RAP2

CDK5RAP2
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5
Внешние идентификаторы	OMIM: 608201 MGI: 2384875 ГомолоГен: 49533 Генные карты: CDK5RAP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q33.2 Начните 120,388,869 бп[1] Конец 120,580,170 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 C2 Начните 70,216,856 бп[2] Конец 70,410,443 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание микротрубочек • связывание тубулина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание кальмодулина • связывание гамма-тубулина Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • полюс митотического веретена • центросома • аппарат Гольджи • полюс шпинделя • перицентриолярный материал • центр организации микротрубочек • плюс-конец микротрубочки • соединение клеток • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоскелет • микротрубочки • внеклеточная экзосома • гамма-тубулиновый кольцевой комплекс Биологический процесс • регуляция дифференцировки нейронов • отрицательная регуляция репликации центриолей • нейрогенез • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов • сегрегация хромосом • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие мозга • G2 / M переход митотического клеточного цикла • образование пучка микротрубочек • регулировка КПП шпинделя • установление ориентации митотического веретена • репликация центриолей • Организация центра организации микротрубочек • организация цитоскелета микротрубочек • стыковка цилиарного базального тела • центросомный цикл • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла • положительное регулирование полимеризации микротрубочек • регуляция контрольной точки сборки веретена митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55755	214444
Ансамбль	ENSG00000136861	ENSMUSG00000039298
UniProt	Q96SN8	P68254 Q8K389
RefSeq (мРНК)	NM_001011649 NM_001272039 NM_018249	NM_145990 NM_001313762
RefSeq (белок)	NP_001011649 NP_001258968 NP_060719	NP_035869 NP_001300691 NP_666102
Расположение (UCSC)	Chr 9: 120,39 - 120,58 Мб	Chr 4: 70,22 - 70,41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5 это белок что у людей кодируется CDK5RAP2 ген. Он играет необходимые роли в формирование и стабильность микротрубочки от центросома^[5] и было обнаружено, что это связано с изменением размера человеческого мозга у мужчин.^[6] Для этого гена существует множество вариантов транскрипта, но полноразмерная природа только двух была определена.^[7][8]

CDK5RAP2 - это гомологичный к Дрозофила белок центросомин (cnn)^[9] и паралогичный к миомегалин, который у млекопитающих содержит Олдувайский домен, область, вовлеченная в эволюцию размера человеческого мозга.^[10][11]

Функция

CDK5RAP2 необходим для правильного формирование, закрепление и ориентация микротрубочки от центросома. Он связан с γ-тубулин звенеть сложный (γTuRC), и это необходимо для γTuRC, чтобы прикрепиться к центросоме.^[5] CDK5RAP2 также связывается с p25, формой CDK5R1 который служит активирующей субъединицей CDK5, который участвует в регуляции нейронального дифференциация. CDK5RAP2, следовательно, играет роль в дифференцировке нейронов.^[8] CDK5RAP2 также необходим как каркасный белок в центросомный корона Диктиостелиум.^[12]

Клиническое значение

Изменение размера человеческого мозга

An МРТ исследование продемонстрировало связь между общими человеческими вариациями гена CDK5RAP2 и структурой мозга. В частности, были обнаружены ассоциации между несколькими однонуклеотидный полиморфизм (SNP) и мозг корковый площадь поверхности и общий объем мозга. Эти ассоциации были обнаружены исключительно у мужчин, и все SNP были расположены либо в последних 7 интроны или вниз по течению гена. Функциональное значение этих места пока не известно. Однако, учитывая их расположение недалеко от регулирующие элементы, возможно, они участвуют в генная регуляция, что предполагает, что общие различия в структуре мозга могут быть связаны с различиями в регуляции генов, а не структурой белка, что согласуется с данными по другим сложным человеческим чертам.^[6] CDK5RAP2 - это паралог из миомегалин, который у млекопитающих содержит Олдувайский домен, домен со специфическими для человека дупликациями, которые были причастны к эволюции размера человеческого мозга.^[10][11]

Аутосомно-рецессивная первичная микроцефалия

Мутации в CDK5RAP2 вызывают аутосомно-рецессивный первичный микроцефалия тип 3.^[13][5]

Взаимодействия

CDK5RAP2 был показан взаимодействовать с CDK5R1^[14] и перицентрин (PCTN).^[8]

История

Ген был открыт в 2000 году.^[15] и впервые был охарактеризован в 2007 году.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136861 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039298 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фонг К.В., Чой Ю.К., Раттнер Дж.Б., Ци Р.З. (январь 2008 г.). «CDK5RAP2 представляет собой перицентриолярный белок, который функционирует в центросомном прикреплении кольцевого комплекса гамма-тубулин». Молекулярная биология клетки. 19 (1): 115–25. Дои:10.1091 / mbc.E07-04-0371. ЧВК  2174194. PMID  17959831.
6. Римол Л. М., Агарц И., Джурович С., Браун А. А., Родди Дж. К., Келер А. К. и др. (Январь 2010 г.). «Зависимая от пола ассоциация распространенных вариантов генов микроцефалии со структурой мозга». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (1): 384–8. Дои:10.1073 / pnas.0908454107. ЧВК  2806758. PMID  20080800.
7. Чинг Ю.П., Ци З., Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Ген. 242 (1–2): 285–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.
8. «Ген Entrez: белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5RAP2 CDK5».
9. Барр А.Р., Килмартин СП, Гергей Ф. (апрель 2010 г.). «CDK5RAP2 функционирует в центросоме для прикрепления полюса веретена и ответа на повреждение ДНК». Журнал клеточной биологии. 189 (1): 23–39. Дои:10.1083 / jcb.200912163. ЧВК  2854379. PMID  20368616.
10. Дюма Л., Ким Ю., Каримпур-Фард А., Кокс М., Хопкинс Дж., Поллак Дж. Р., Сикела Дж. М. (сентябрь 2007 г.). «Вариация числа копий гена за 60 миллионов лет эволюции человека и приматов». Геномные исследования. 17 (9): 1266–77. Дои:10.1101 / гр.6557307. ЧВК  1950895. PMID  17666543.
11. О'Блесс М.С., Диккенс С.М., Дюма Л.Дж., Керер-Саватцки Г., Вайкофф Г.Дж., Сикела Дж.М. (сентябрь 2012 г.). «Эволюционная история и организация генома доменов белка DUF1220». G3. 2 (9): 977–86. Дои:10.1534 / g3.112.003061. ЧВК  3429928. PMID  22973535.
12. Питцен В., Аскарзада С., Греф Р., Мейер И. (апрель 2018 г.). «CDK5RAP2 является важным каркасным белком короны центросомы Dictyostelium». Клетки. 7 (4): 32. Дои:10.3390 / ячейки7040032. ЧВК  5946109. PMID  29690637.
13. «Запись OMIM - № 604804 - МИКРОЦЕФАЛИЯ 3, ПЕРВИЧНЫЙ, АВТОСОМНЫЙ РЕЦЕССИВ; MCPH3». www.omim.org. Получено 2020-01-06.
14. Ван Х, Цзин Ю.П., Лам У.Х., Ци З., Чжан М., Ван Дж.Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5». Журнал биологической химии. 275 (41): 31763–9. Дои:10.1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
15. Чинг Ю.П., Ци З., Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Ген. 242 (1–2): 285–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.

дальнейшее чтение

• Мойнихан Л., Джексон А.П., Робертс Э., Карбани Г., Льюис И., Корри П. и др. (Февраль 2000 г.). «Третий новый локус первичной аутосомно-рецессивной микроцефалии отображается на хромосоме 9q34». Американский журнал генетики человека. 66 (2): 724–7. Дои:10.1086/302777. ЧВК  1288125. PMID  10677332.
• Ван Х, Цзин Ю.П., Лам У.Х., Ци З., Чжан М., Ван Дж.Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5». Журнал биологической химии. 275 (41): 31763–9. Дои:10.1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (август 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (4): 273–81. Дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID  10997877.
• Чинг Ю.П., Пан А.С., Лам У.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (май 2002 г.). «Идентификация нейронального белка, связывающего активатор Cdk5, в качестве ингибитора Cdk5». Журнал биологической химии. 277 (18): 15237–40. Дои:10.1074 / jbc.C200032200. PMID  11882646.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Геномные исследования. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Андерсен Дж. С., Уилкинсон С. Дж., Мэр Т., Мортенсен П., Нигг Е. А., Манн М. (декабрь 2003 г.). «Протеомная характеристика центросомы человека с помощью профилирования корреляции белков». Природа. 426 (6966): 570–4. Дои:10.1038 / природа02166. PMID  14654843. S2CID  4427303.
• Бонд Дж., Робертс Э., Спрингелл К., Лизаррага С.Б., Лизаррага С., Скотт С. и др. (Апрель 2005 г.). «Центросомный механизм с участием CDK5RAP2 и CENPJ контролирует размер мозга». Природа Генетика. 37 (4): 353–5. Дои:10,1038 / ng1539. PMID  15793586. S2CID  1763877.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Evans PD, Vallender EJ, Lahn BT (июнь 2006 г.). «Молекулярная эволюция генов регуляторов размера мозга CDK5RAP2 и CENPJ». Ген. 375: 75–9. Дои:10.1016 / j.gene.2006.02.019. PMID  16631324.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• Человек CDK5RAP2 расположение генома и CDK5RAP2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.